ngsbrowser

(Удалено) Откройте NGS Browser, чтобы визуализировать и исследовать выравнивания

ngsbrowser был удален. Вместо этого используйте Genomics Viewer.

Синтаксис

Описание

ngsbrowser открывает приложение NGS Browser.

ngsbrowser(bmObj) импортирует объект BioMap bmObj и открывает его в приложении NGS Browser.

Входные параметры

свернуть все

Объект, содержащий информацию о последовательности или коротко считанные данные о выравнивании последовательности, заданные как BioMap объект.

Примеры

свернуть все

Создайте объект BioMap из файла с форматированием SAM.

b = BioMap('ex1.sam');

Отображение объекта в NGS Browser.

ngsbrowser(b)

Совет

  • Используйте NGS Browser, чтобы сравнить выравнивание нескольких наборов данных с общей ссылочной последовательностью.

  • Используйте NGS Browser, чтобы исследовать необходимые области в краткочитаемом выравнивании, определенном различными анализами, такими как RNA-Seq, ChIP-Seq и анализы генетического изменения.

Вопросы совместимости

расширить все

Ошибки, начинающиеся в R2021a

Введенный в R2011b