nuc44

Возвращайте NUC44 скоринговую матрицу для нуклеотидных последовательностей

Синтаксис

ScoringMatrix = nuc44
[ScoringMatrix, MatrixInfo] = nuc44

Описание

ScoringMatrix = nuc44 возвращает матрицу скоринга. The nuc44 матрица скоринга использует неоднозначные нуклеотидные коды и вероятности, округленные до ближайшее целого числа.

Шкала = 0.277316

Ожидаемый счет = -1.7495024, Энтропия = 0.5164710 биты

Самый низкий счет = -4, Наивысший счет = 5

Порядок: A C G T R Y K M S W B D H V N

[ScoringMatrix, MatrixInfo] = nuc44 возвращает структуру с информацией о матрице с полями Name и Order.

Примечание

Матрица оценки NUC44 поставляется NCBI и используется набором программ BLAST. Для получения дополнительной информации смотрите ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/matrices/.

См. также

| | | | | |

Представлено до R2006a