phytreeviewer

Визуализация, редактирование и исследование данных филогенетического дерева

Синтаксис

phytreeviewer

phytreeviewer(Tree)

phytreeviewer(File)

Описание

phytreeviewer открывает приложение Phylogenetic Tree, которое позволяет просматривать, редактировать и исследовать данные филогенетического дерева.

phytreeviewer(Tree) загружает phytree Tree объекта в приложение.

phytreeviewer(File) загружает данные из файла дерева Newick или ClustalW в приложение.

Входные параметры

свернуть все

`Tree` - Филогенетическое дерево
`Phytree` объект

Филогенетическое дерево, заданное как Phytree объект, созданный с помощью функций phytree или phytreeread.

`File` - Форматированный файл дерева Newick или ClustalW
вектор символов | строка

Форматированный файл дерева Newick или ClustalW, заданный как вектор символов или строка, содержащая имя файла, путь и имя файла или URL-адрес, указывающий на файл.

Примеры

свернуть все

Просмотр Phylogenetic Tree

Открыть Live Script

Этот пример показывает, как просмотреть филогенетическое дерево.

Загрузите выборку филогенетического дерева.

tr= phytreeread('pf00002.tree')

    Phylogenetic tree object with 33 leaves (32 branches)

Просмотрите филогенетическое дерево.

phytreeviewer(tr)

Figure Phylogenetic Tree 1 contains an axes. The axes contains 72 objects of type line.

Также можно щелкнуть Phylogenetic Tree на вкладке Приложения, чтобы открыть приложение и просмотреть объект филогенетического дерева tr .

См. также

Введенный в R2012b

Документация по Bioinformatics Toolbox

Поддержка

Памятка переводчика

1. Если смысл перевода понятен, то лучше оставьте как есть и не придирайтесь к словам, синонимам и тому подобному. О вкусах не спорим.

2. Не дополняйте перевод комментариями “от себя”. В исправлении не должно появляться дополнительных смыслов и комментариев, отсутствующих в оригинале. Такие правки не получится интегрировать в алгоритме автоматического перевода.

3. Сохраняйте структуру оригинального текста - например, не разбивайте одно предложение на два.

4. Не имеет смысла однотипное исправление перевода какого-то термина во всех предложениях. Исправляйте только в одном месте. Когда Вашу правку одобрят, это исправление будет алгоритмически распространено и на другие части документации.

5. По иным вопросам, например если надо исправить заблокированное для перевода слово, обратитесь к редакторам через форму технической поддержки.

Документация