view (phytree)

Просмотр филогенетического дерева

Синтаксис

view(Tree)
view(Tree, IntNodes)

Аргументы

Tree

Филогенетическое дерево (phytree объект), созданный с помощью функции phytree.

IntNodes

Узлы из phytree объект, который будет первоначально отображаться в Tree.

Описание

view(Tree) открывает окно Phylogenetic Tree и рисует дерево из данных в phytree объект (Tree). Значительные расстояния между ветвями и узлами находятся в горизонтальном направлении. Вертикальные расстояния не имеют значения и выбираются только в целях отображения. Вы можете получить доступ к инструментам для редактирования и анализа дерева из панели меню Phylogenetic Tree или с помощью левой и правой кнопок мыши.

view(Tree, IntNodes) открывает окно Phylogenetic Tree с начальным выбором узлов, заданных IntNodes. IntNodes может быть логическим массивом любого из следующих размеров: NumLeaves + NumBranches x 1, NumLeaves x 1, или NumBranches x 1. IntNodes также может быть список индексов.

Примеры

свернуть все

Загрузите и просмотрите выборку филогенетического дерева.

tr = phytreeread('pf00002.tree');
view(tr)

Представлено до R2006a