seqrcomplement

Вычисление обратной комплементарной цепи нуклеотидной последовательности

Синтаксис

SeqRC = seqrcomplement(SeqNT)

Аргументы

SeqNT

Нуклеотидная последовательность, заданная любым из следующих:

Вектор символов с буквами A, C, G, T, U, и неоднозначные символы R, Y, K, M, S, W, B, D, H, V, N.
Вектор-строка из целых чисел из таблицы Сопоставление нуклеотидных целых чисел с буквенными кодами.
MATLAB^® структура, содержащая Sequence поле, которое содержит нуклеотидную последовательность, такую как возвращенная emblread, fastaread, fastqread, genbankread, getembl, или getgenbank.

Описание

SeqRC = seqrcomplement(SeqNT) вычисляет обратную комплементарную цепь нуклеотидной последовательности ДНК или РНК. Последовательность возврата, SeqRC, читается из 3 '-- > 5' и имеет тот же формат, что и SeqNT. Для примера, если SeqNT является вектором целых чисел, тогда это так же SeqRC.

Нуклеотид в SeqNT	Преобразуется в этот нуклеотид в SeqRC
`A`	`T` или `U`
`C`	`G`
`G`	`C`
`T` или `U`	`A`

Примеры

Возвращает обратное дополнение ДНК нуклеотидной последовательности.

s = 'ATCG'
seqrcomplement(s)

ans =
CGAT

См. также

codoncount | palindromes | seqcomplement | seqreverse | seqviewer

Представлено до R2006a

Документация по Bioinformatics Toolbox

Поддержка

Памятка переводчика

1. Если смысл перевода понятен, то лучше оставьте как есть и не придирайтесь к словам, синонимам и тому подобному. О вкусах не спорим.

2. Не дополняйте перевод комментариями “от себя”. В исправлении не должно появляться дополнительных смыслов и комментариев, отсутствующих в оригинале. Такие правки не получится интегрировать в алгоритме автоматического перевода.

3. Сохраняйте структуру оригинального текста - например, не разбивайте одно предложение на два.

4. Не имеет смысла однотипное исправление перевода какого-то термина во всех предложениях. Исправляйте только в одном месте. Когда Вашу правку одобрят, это исправление будет алгоритмически распространено и на другие части документации.

5. По иным вопросам, например если надо исправить заблокированное для перевода слово, обратитесь к редакторам через форму технической поддержки.