part_of property

Класс: термин

Числовой массив только для чтения, содержащий идентификаторы GO терминов GO, которые имеют отношение «часть» с этим термином GO

Описание

part_of является свойством класса term только для чтения. part_of - вектор-столбец, содержащая идентификаторы GO. Эти идентификаторы GO задают другие объекты терминов, к которым у объекта терминов есть отношение «part_of». Объект термина является подмножеством объектов термина, заданных его part_of свойство.

Значения

Возможные значения являются идентификаторами терминов GO из базы данных Gene Ontology. Используйте part_of свойство для определения идентификаторов GO терминов GO, которые имеют отношение «часть» с определенным термином GO.

Примеры

Пример 91. Использование свойства part_of для определения термина Объекты с «частью» отношения
  1. Загрузите текущую версию базы данных Gene Ontology из Web в объект генеонта в MATLAB® программное обеспечение.

    GeneontObj = geneont('LIVE', true)

    MATLAB создает объект geneont и отображает количество объектов терминов, связанных с объектом geneont.

    Gene Ontology object with 27769 Terms.
  2. Отображение объектов терминов, к которым у объекта терминов в 18, 703-й позиции есть отношение «часть».

    GeneontObj.terms(18703).part_of
    
    ans =
    
           50802
    

Совет

Можно также использовать getancestors метод объекта генеонта с 'Relationtype' значение свойства установлено в 'part_of' для определения объектов терминов с отношением «часть».

Совет

Если вы знаете идентификатор GO (для примера, 42321) объекта термина, вместо его индекса или номера позиции (для примера, 18703), можно использовать следующий синтаксис, чтобы отобразить part_of свойство объекта термина:

GeneontObj(42321).terms.part_of

Для получения помощи в преобразовании индекса или номера позиции объекта термина в его идентификатор GO, смотрите term.id свойство.