simbio.diagram.getBlock

Получите свойства блока SimBiology

Свернуть все на странице

Синтаксис

SV = simbio.diagram.getBlock(sObj)

SV = simbio.diagram.getBlock(speciesObj,exprObj)

QV = simbio.diagram.getBlock(sObj,propertyNames)

QV = simbio.diagram.getBlock(speciesObj,exprObj,propertyNames)

simbio.diagram.getBlock(___)

Описание

пример

SV = simbio.diagram.getBlock(sObj) возвращает имена и текущие значения свойств блоков объекта SimBiology sObj как структура SV.

Примечание

Прежде чем запускать функцию в командной строке:

Откройте соответствующую модель SimBiology в приложении SimBiology Model Builder.
Экспортируйте модель из приложения в MATLAB^® рабочей области путем выбора Export > Export Model to MATLAB Workspace на вкладке Home приложения.

Можно запросить и сконфигурировать только свойства объектов, показанных на вкладке Diagram приложения. Объекты, показанные на схеме, являются отсеками, видами, реакциями, правилами скорости, повторными правилами назначения и параметрами, которые находятся на левой стороне правила скорости, повторного правила назначения или функции события.

пример

SV = simbio.diagram.getBlock(speciesObj,exprObj) возвращает имена и текущие значения свойств блоков видового объекта speciesObj который связан с объектом выражения (реакция, правило скорости или повторное правило назначения) exprObj. Можно использовать этот синтаксис для настройки Position, Pin, и Visible свойства определенного клонированного блока, когда у вас есть несколько клонов одного и того же вида. Клоны имеют одинаковые значения для всех других свойств.

пример

QV = simbio.diagram.getBlock(sObj,propertyNames) возвращает значения заданных свойств блоков propertyNames объекта SimBiology sObj.

пример

QV = simbio.diagram.getBlock(speciesObj,exprObj,propertyNames) возвращает имена и текущие значения заданных свойств блоков propertyNames видового объекта speciesObj который соединяется с объектом выражения exprObj.

пример

simbio.diagram.getBlock(___) отображает имена и значения свойств блоков. Используйте этот синтаксис с любым из входных параметров в предыдущих синтаксисах.

Примеры

свернуть все

Конфигурирование свойств блоков SimBiology

Можно программно настроить внешние виды и местоположение блоков схем модели SimBiology.

Откройте lotka модель в приложении SimBiology Model Builder.

simBiologyModelBuilder('lotka');

Приложение откроется и покажет модель на вкладке Diagram.

На вкладке Home приложения выберите Export > Export Model to MATLAB Workspace.

В диалоговом окне SimBiology Model Export нажмите OK, чтобы экспортировать модель с m1 имени переменной.

Перейдите в командную строку MATLAB и подтвердите, что m1 модели находится в рабочей области. Получите список видов модели.

m1.Species

ans = 

   SimBiology Species Array

   Index:    Compartment:    Name:    Value:    Units:
   1         unnamed         x        1               
   2         unnamed         y1       900             
   3         unnamed         y2       900             
   4         unnamed         z        0

Получите текущую форму блока видовых x.

x = m1.Species(1);
v = simbio.diagram.getBlock(x,'Shape')

v =

    'rounded rectangle'

Получите список всех возможных фигур для блока видов.

simbio.diagram.setBlock(x,'Shape')

ans =

  8×1 cell array

    {'rounded rectangle'}
    {'rectangle'        }
    {'oval'             }
    {'triangle'         }
    {'hexagon'          }
    {'chevron'          }
    {'parallelogram'    }
    {'diamond'          }

Установите форму блока видов в овал.

simbio.diagram.setBlock(x,'Shape','oval')

Получите текущее положение блока. Первые два числа представляют координаты x и y относительно верхнего левого угла (x = 0, y = 0) схемы. Последние два числа представляют ширину и высоту блока.

simbio.diagram.getBlock(x,'Position')

ans =

   223   137    30    15

Установите положение в новое место.

simbio.diagram.setBlock(x,'Position',[260 130 30 15])

Можно также настроить несколько свойств.

simbio.diagram.setBlock(x,'FaceColor','yellow','FontSize',20,'TextLocation','center')

Сконфигурируйте свойства блока Cloned Species

Когда у вас есть несколько клонированных блоков для одного и того же вида в схеме SimBiology, можно программно настроить положение и видимость определенного клона, задав блок экспрессии, с которым связан клонированный вид. Другими словами, можно изменить Position, Pin, и Visible свойства, характерные для отдельного клона. Все другие свойства имеют одинаковые значения для всех клонов одного и того же вида.

Откройте gprotein модель в приложении SimBiology Model Builder.

simBiologyModelBuilder('gprotein');

Приложение откроется и покажет модель на вкладке Diagram.

На вкладке Home приложения выберите Export > Export Model to MATLAB Workspace.

В диалоговом окне SimBiology Model Export нажмите OK, чтобы экспортировать модель с m1 имени переменной.

m1.Species

ans = 

   SimBiology Species Array

   Index:    Compartment:    Name:    Value:       Units:
   1         unnamed         G        7000               
   2         unnamed         Gd       3000               
   3         unnamed         Ga       0                  
   4         unnamed         RL       0                  
   5         unnamed         L        6.022e+17          
   6         unnamed         R        10000              
   7         unnamed         Gbg      3000

Видовой блок Gbg клонирован и связан с двумя реакциями: G protein activation и G protein complex formation. Получите текущее положение клонированного блока, соединенного со второй реакцией.

Gbg = m1.Species(7);
r2 = m1.Reaction(2);
simbio.diagram.getBlock(Gbg,r2,'Position')

ans =

   393   307    30    15

Открепите клонированный блок и переместите его в другое положение.

simbio.diagram.setBlock(Gbg,r2,'Pin',false,'Position',[391 340 30 15])

Входные параметры

свернуть все

`sObj` - Объект SimBiology
`Compartment` | объекта `Species` | объекта `Reaction` | объекта `Rule` | объекта `Parameter` объект | массив объектов

Объект SimBiology, заданный как Compartment, Species, Reaction, Rule, или Parameter объект или как массив объектов.

`propertyNames` - Имена свойств блоков
вектор символов | строка | строковый вектор | массив ячеек из векторов символов

Имена свойств блоков, заданные как вектор символов, строка, строковый вектор или массив ячеек из векторов символов. Можно задать несколько имена свойства как 1-by- N или N -by- 1 массив ячеек с именами.

Ниже приведены доступные свойства блоков.

Имя свойства	Описание
`Connections`	Свойство только для чтения, в котором перечислены объекты, соединенные с блоком входа
`Cloned`	Флаг только для чтения, указывающий, существует ли более одного блока для объекта входа. Можно клонировать только видовые блоки.
`EdgeColor`	Ребро блока, заданный как одно из следующих значений: Триплет RGB, такой как `[1 1 0]` Вектор символов или строка, представляющая название цвета, например `'y'` или `'yellow'` Для получения дополнительной информации смотрите `ColorSpec (Color Specification)`.
`ExpressionLines`	Флаг для отображения линий из блока выражения в другие компоненты модели, на которые ссылается выражение, заданный как `'show'` или `'hide'`. Вы можете задать это свойство для реакций или правил.
`FaceColor`	Блочный цвет грани, заданный как одно из следующих значений: Триплет RGB, такой как `[1 1 0]` Вектор символов или строка, представляющая название цвета, например `'y'` или `'yellow'` Для получения дополнительной информации смотрите `ColorSpec (Color Specification)`.
`FontName`	Блочный шрифт, заданный как вектор символов или строка. Допустимые опции: `'Arial'` `'Arial Black'` `'Arial Narrow'` `'Comic Sans MS'` `'Courier'` `'Courier New'` `'Georgia'` `'Helvetica'` `'Impact'` `'Times New Roman'` `'Trebuchet MS'` `'Verdana'`
`FontSize`	Блок шрифта, заданный как положительная скалярная величина
`FontWeight`	Блок шрифта, заданная как `'plain'`, `'bold'`, `'italic'`, или `'bold italic'`
`Object`	Свойство только для чтения, которое приводит соответствующий объект SimBiology блока
`Pin`	Флаг, указывающий, можно ли переместить блок или нет. Установите для свойства значение `false` чтобы разрешить перемещение блока в схеме.
`Position`	Положение и размер блока, заданные как четырехэлементный вектор `[x,y,width,height]`. Положение верхнего левого угла схемы равно x = 0 и y = 0. SimBiology настраивает все положения блоков относительно этого угла. Можно сконфигурировать позиции блоков в отрицательные положения.
`Rotate`	Вращение блока, заданное как скаляр между 0 и 360. Вы не можете вращать блоки отсеков.
`Shape`	Блочная форма, заданная как вектор символов или строка. Допустимые опции: `'rounded rectangle'` `'rectangle'` `'oval'` `'triangle'` `'hexagon'` `'chevron'` `'parallellogram'` `'diamond'` Блоки отсеков должны быть `'rounded rectangle'` или `'rectangle'`.
`TextColor`	Блокируйте цвет текста, заданный как одно из следующих значений: Триплет RGB, такой как `[1 1 0]` Вектор символов или строка, представляющая название цвета, например `'y'` или `'yellow'` Для получения дополнительной информации смотрите `ColorSpec (Color Specification)`.
`TextLocation`	Блочное расположение текста относительно блока, заданное как одно из следующего: `'top'`, `'left'`, `'bottom'`, `'right'`, `'center'`, или `'none'`
`Visible`	Флаг, указывающий, виден ли блок в схеме. Установите значение свойства `false` чтобы скрыть блок.

Пример: 'Position'

Типы данных: double | char | string | cell

`speciesObj` - Видовой объект
`Species` объект

Видовой объект, заданный как SimBiology Species объект. speciesObj должно быть скалярным.

`exprObj` - Объект выражения
`Reaction` | объекта `Rule` объект

Объект выражения, заданный как Reaction или Rule объект. Объектом правила может быть правило скорости или повторное правило назначения. exprObj должно быть скаляром.

Выходные аргументы

свернуть все

`QV` - Значения запрашиваемых свойств
числовой вектор | вектор символов | логический скаляр | объект | массив ячеек

Значения запрашиваемых свойств, возвращенные как числовой вектор, вектор символов, логический скаляр, объект SimBiology или массив ячеек.

Если sObj - массив объектов, QV является M -by- 1 массив ячеек значений, где M равен длине sObj.

Если вы также задаете N -by - 1 или 1-by - N массив ячеек для propertyNames, QV - M -by - N массив значений, где N - количество свойств.

`SV` - Структура наименований и значений свойств
структура | массив структур

Структура имен свойства и значений, возвращенная как структура или массив структур. Имена полей являются именами свойства объектов, а значения - текущими значениями соответствующих свойств.

Если sObj - массив объектов, SV - массив структур. Функция возвращает по одной структуре на блок. Если sObj имеет несколько клонированных блоков, SV содержит структуру для каждого клонированного блока.

См. также

Темы

Введенный в R2021a

Документация

simbio.diagram.getBlock

Синтаксис

Описание

Примеры

Конфигурирование свойств блоков SimBiology

Сконфигурируйте свойства блока Cloned Species

Входные параметры

`sObj` - Объект SimBiology
`Compartment` | объекта `Species` | объекта `Reaction` | объекта `Rule` | объекта `Parameter` объект | массив объектов

`propertyNames` - Имена свойств блоков
вектор символов | строка | строковый вектор | массив ячеек из векторов символов

`speciesObj` - Видовой объект
`Species` объект

`exprObj` - Объект выражения
`Reaction` | объекта `Rule` объект

Выходные аргументы

`QV` - Значения запрашиваемых свойств
числовой вектор | вектор символов | логический скаляр | объект | массив ячеек

`SV` - Структура наименований и значений свойств
структура | массив структур

См. также

Темы

Документация SimBiology

Поддержка

Документация

simbio.diagram.getBlock

Синтаксис

Описание

Примеры

Конфигурирование свойств блоков SimBiology

Сконфигурируйте свойства блока Cloned Species

Входные параметры

sObj - Объект SimBiology Compartment | объекта Species | объекта Reaction | объекта Rule | объекта Parameter объект | массив объектов

propertyNames - Имена свойств блоков вектор символов | строка | строковый вектор | массив ячеек из векторов символов

speciesObj - Видовой объект Species объект

exprObj - Объект выражения Reaction | объекта Rule объект

Выходные аргументы

QV - Значения запрашиваемых свойств числовой вектор | вектор символов | логический скаляр | объект | массив ячеек

SV - Структура наименований и значений свойств структура | массив структур

См. также

Темы

Документация SimBiology

Поддержка

`sObj` - Объект SimBiology
`Compartment` | объекта `Species` | объекта `Reaction` | объекта `Rule` | объекта `Parameter` объект | массив объектов

`propertyNames` - Имена свойств блоков
вектор символов | строка | строковый вектор | массив ячеек из векторов символов

`speciesObj` - Видовой объект
`Species` объект

`exprObj` - Объект выражения
`Reaction` | объекта `Rule` объект

`QV` - Значения запрашиваемых свойств
числовой вектор | вектор символов | логический скаляр | объект | массив ячеек

`SV` - Структура наименований и значений свойств
структура | массив структур