SimBiology Model Builder

Создание моделей биологии QSP, PK/PD и механистических систем в интерактивном режиме

Описание

Приложение SimBiology Model Builder позволяет вам создавать модели динамических систем, таких как модели фармакологии количественных систем (QSP), фармакокинетические/фармакодинамические (PK/PD) модели и модели биологии систем в интерактивном режиме. Он предоставляет редактор блок-схем для создания принципиальной реакции модели с помощью встроенных блоков.

Используя приложение, вы можете:

  • Создайте различные динамические системы, такие как метаболические сети, сигнальные пути, модели QSP, модели PBPK и модели PK/PD.

  • Создайте стандартные компартментные модели PK из встроенной библиотеки.

  • Рассмотрим свою модель как графическое представление или как математические уравнения.

  • Используйте варианты для хранения набора значений параметров или начальных условий, которые отличаются от строения базовой модели.

  • Создайте массив доз, чтобы исследовать различные схемы дозирования.

  • Импорт или экспорт моделей SimBiology в и из MATLAB® рабочая область или из файла Systems Biology Markup Language (SBML).

SimBiology Model Builder app

Откройте приложение SimBiology Model Builder

  • MATLAB панели инструментов: На вкладке Apps, в разделе Computational Biology, нажмите значок приложения.

  • Командная строка MATLAB: Ввод simbiology.

Программное использование

расширить все

simBiologyModelBuilder открывает приложение.

simBiologyModelBuilder(m1) открывает модель SimBiology m1 в приложении SimBiology Model Builder.

Если SimBiology Model Builder или SimBiology Model Analyzer приложение уже открыто, вы не можете загрузить модель или проект из командной строки. Загрузите модель из приложения непосредственно.

simBiologyModelBuilder(prjFile) открывает файл проекта prjFile в приложении SimBiology Model Builder prjFile. - строка или вектор символов, задающий имя файла или путь и имя файла файла SBPROJ проекта SimBiology. Если вы задаете только имя файла, файл должен быть в пути поиска файлов MATLAB или в текущей папке.

Если SimBiology Model Builder или SimBiology Model Analyzer приложение уже открыто, вы не можете загрузить модель или проект из командной строки. Загрузите модель из приложения непосредственно.

Вопросы совместимости

расширить все

Поведение изменено в R2020b

Введенный в R2020b