SimBiology предоставляет набор интегрированных приложений, которые предназначены для создания, симуляции и анализа моделей динамических систем, таких как количественная системная фармакология (QSP), фармакокинетическая/фармакодинамическая (PK/PD) и модели системной биологии.
Приложение SimBiology Model Builder позволяет вам создавать динамические модели в интерактивном режиме с использованием различных элементов моделирования. Например, можно смоделировать различные биологические системы, такие как сигнальные пути, метаболические сети, PBPK, QSP и модели PK/PD. Это также позволяет вам модели биологическую изменчивость и различные схемы дозирования, чтобы исследовать различные экспериментальные условия и стратегии дозирования.
Приложение SimBiology Model Analyzer позволяет вам выполнять анализ на моделях динамических систем. Можно симулировать динамическое поведение модели с помощью различных решателей и оценить параметры модели. Чтобы исследовать динамику системы и направлять эксперименты, можно выполнить анализ чувствительности и свипы параметра.
| SimBiology Model Builder | Создание моделей биологии QSP, PK/PD и механистических систем в интерактивном режиме |
| SimBiology Model Analyzer | Анализ моделей биологии QSP, PK/PD и механистических систем |
simbio.diagram.getBlock | Получите свойства блока SimBiology |
simbio.diagram.setBlock | Установка свойств блоков SimBiology |
simbio.diagram.getLine | Получите свойства линии схемы SimBiology |
simbio.diagram.setLine | Установка свойств линий схем SimBiology |
simbio.diagram.splitBlock | Разделите блок видов SimBiology на схемы |
simbio.diagram.joinBlock | Объедините все копии блоков видов SimBiology в схеме |
Создайте модель кинетики рецептора-лиганда
Этот пример показывает, как создать и симулировать простую модель кинетики рецептор-лиганд с помощью SimBiology Model Builder и SimBiology Model Analyzer приложений.
Включить ингибирование рецептора 2 (SGLT2) глюкозы натрия гипотетическим соединением в существующую модель глюкозо-инсулина.
Скопируйте и вставьте блоки SimBiology во время построения моделей в Схеме.
Горячие клавиши для SimBiology Model Builder
Приложение SimBiology Model Builder предоставляет горячие клавиши для различных действий моделирования.
SimBiology моделирует библиотеки компонентов
SimBiology® библиотеки являются наборами встроенных компонентов, которые можно использовать для создания и анализа моделей.
Значки индикатора сообщения в SimBiology Model Builder
Приложение SimBiology Model Builder использует контекстные значки, чтобы предоставить больше информации о компонентах модели в таблицах браузера и блоках на вкладке Diagram.
Отмена и повторное изменение модели в SimBiology
Можно отменить и повторить действия, связанные с построением моделей и конфигурированием свойств блоков.
Выполните некомпартментный анализ и калибруйте параметры модели путем подгонки к экспериментальным данным PKPD с помощью нелинейной регрессии.
Найдите важные параметры с анализом чувствительности с помощью приложения SimBiology Model Analyzer
Выполните анализ чувствительности, чтобы найти важные параметры модели.
Сгенерируйте значения выборки для параметров модели, чтобы представлять виртуальных пациентов и моделировать, чтобы исследовать изменчивость модели.
Схемы дозирования скана с использованием приложения SimBiology Model Analyzer
Исследуйте несколько количеств дозирования, которые соответствуют порогам эффективности и токсичности.
