SimBiology Model Analyzer

Анализ моделей биологии QSP, PK/PD и механистических систем

Описание

Приложение SimBiology Model Analyzer позволяет вам анализировать модели динамических систем, таких как метаболические сети, сигнальные пути, модели количественной системной фармакологии (QSP) и фарамакокинетические/фармакодинамические (PK/PD) модели лекарств. Он предоставляет несколько методов анализа моделей и различных графиков для визуализации результатов.

Используя приложение, вы можете:

  • Симулируйте модель, чтобы увидеть ее динамическое поведение с течением времени.

  • Исследуйте биологическую изменчивость, моделируя альтернативные сценарии, такие как виртуальные пациенты.

  • Оцените параметры модели с помощью нелинейной регрессии и нелинейных методов смешанных эффектов.

  • Выполните сканы параметров и анализ чувствительности, чтобы исследовать влияние параметров модели и начальных условий на поведение модели.

  • Задайте модули и дайте приложению автоматически преобразовать соответствующие физические величины в одну согласованную единичную систему.

  • Исследуйте различные схемы дозирования.

  • Выполните некомпартментный анализ (NCA), чтобы вычислить параметры PK препарата из его данных PK.

  • Просмотрите результаты анализа на различных графиках.

Доступные графики

Приложение позволяет вам визуализировать результаты анализа с помощью различных графиков, включая:

  • Временной ход моделируемых величин

  • Матрица чувствительности

  • Наложение предполагаемых результатов на экспериментальные данные

  • Графики для измерения качества подгонки, такое как доверие интервала графики, невязки, остаточные графики распределения, фактические и предсказанные графики и прямоугольные графики

  • График поля точек

SimBiology Model Analyzer app

Откройте приложение SimBiology Model Analyzer

  • MATLAB® панель инструментов: На вкладке Apps, в разделе Computational Biology, щелкните значок приложения.

  • Командная строка MATLAB: Ввод simBiologyModelAnalyzer.

Программное использование

расширить все

simBiologyModelAnalyzer открывает приложение SimBiology Model Analyzer.

simBiologyModelAnalyzer(m1) открывает модель SimBiology m1 в приложении SimBiology Model Analyzer.

Если SimBiology Model Builder или SimBiology Model Analyzer приложение уже открыто, вы не можете загрузить модель или проект из командной строки. Загрузите модель из приложения непосредственно.

simBiologyModelAnalyzer(prjFile) открывает файл проекта prjFile в приложении SimBiology Model Analyzer file. - строка или вектор символов, задающий имя файла или путь и имя файла файла SBPROJ проекта SimBiology. Если вы задаете только имя файла, файл должен быть в пути поиска файлов MATLAB или в текущей папке.

Если SimBiology Model Builder или SimBiology Model Analyzer приложение уже открыто, вы не можете загрузить модель или проект из командной строки. Загрузите модель из приложения непосредственно.

Вопросы совместимости

расширить все

Поведение изменено в R2020b

Введенный в R2019b