geneticcode

Возвратите кодон нуклеотида в отображение аминокислоты для генетического кода

Синтаксис

Map = geneticcode Map = geneticcode(GeneticCode)

Входные параметры

GeneticCode

Целое число, вектор символов или строка, задающая номер генетического кода или кодовое название из таблицы Genetic Code. Значением по умолчанию является 1 или 'Standard'.

Совет

Если вы используете кодовое название, можно обрезать имя к первым двум буквам имени.

Выходные аргументы

Map Структура, содержащая отображение кодонов нуклеотида к аминокислотам для стандартного генетического кода. Map структура содержит поле для каждого кодона нуклеотида.

Описание

Map = geneticcode возвращает структуру, содержащую отображение кодонов нуклеотида к аминокислотам для стандартного генетического кода. Map структура содержит поле для каждого кодона нуклеотида.

Map = geneticcode(GeneticCode) возвращает структуру, содержащую отображение кодонов нуклеотида к аминокислотам для заданного генетического кода. GeneticCode также:

Целое число, вектор символов или строка, задающая номер кода или кодовое название из таблицы Genetic Code
transl_table (код) номер от веб-страницы NCBI, описывающей генетические коды:
```
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Utils/wprintgc.cgi?mode=c
```

Совет

Если вы используете кодовое название, можно обрезать имя к первым двум буквам имени.

Генетический код

Номер кода	Кодовое название
1	`Standard`
2	`Vertebrate Mitochondrial`
3	`Yeast Mitochondrial`
4	`Mold`, `Protozoan`, `Coelenterate Mitochondrial`, и `Mycoplasma/Spiroplasma`
5	`Invertebrate Mitochondrial`
6	`Ciliate`, `Dasycladacean`, и `Hexamita Nuclear`
9	`Echinoderm Mitochondrial`
10	`Euplotid Nuclear`
11	`Bacterial` и `Plant Plastid`
12	`Alternative Yeast Nuclear`
13	`Ascidian Mitochondrial`
14	`Flatworm Mitochondrial`
15	`Blepharisma Nuclear`
16	`Chlorophycean Mitochondrial`
21	`Trematode Mitochondrial`
22	`Scenedesmus Obliquus Mitochondrial`
23	`Thraustochytrium Mitochondrial`

Примеры

Возвратите отображение кодонов нуклеотида к аминокислотам для Плоского червя Митохондриальный генетический код.

wormmap = geneticcode('Flatworm Mitochondrial');

Ссылки

[1] Веб-страница NCBI, описывающая генетические коды:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Utils/wprintgc.cgi?mode=c

Представлено до R2006a

Документация