Создайте QSP, PBPK, PK/PD и модели системной биологии графически с помощью редактора блок-схемы или программно с помощью MATLAB® функции. Используйте дозы, чтобы смоделировать различные режимы дозирования и варианты использования, чтобы представлять биологическую изменчивость и что - если сценарии.
| SimBiology Model Builder | Создайте QSP, PK/PD и механистические модели системной биологии в интерактивном режиме |
| SimBiology Model Analyzer | Анализируйте QSP, PK/PD и механистические модели системной биологии |
sbiomodel | Создайте объект модели |
sbioroot | Возвратите корневой объект SimBiology |
sbioreset | Удалите все объекты модели |
sbioselect | Ищите объекты с заданными ограничениями |
addcompartment | Создайте объект отсека |
addCompartment | Добавьте отсек в PKModelDesign объект |
addobservable | Добавьте заметный объект в модель SimBiology |
addspecies | Создайте разновидности, возражают и добавляют к объекту отсека в объекте модели |
addparameter | Создайте объект параметра и добавьте к или кинетическому объекту закона модели |
addreaction | Создайте реакцию, возражают и добавляют к объекту модели |
addrule | Создайте правило, возражают и добавляют к объекту модели |
addevent | Добавьте объект-событие в объект модели |
construct | Создайте модель SimBiology из PKModelDesign объект |
Создайте модель кинетики лиганда приемника
В этом примере показано, как создать и симулировать простую модель кинетики лиганда приемника с помощью приложений SimBiology Model Analyzer и SimBiology Model Builder.
Включите котранспортер глюкозы натрия 2 ингибирования приемника (SGLT2) гипотетическим составным объектом в существующую модель инсулина глюкозы.
В этом примере показано, как создать простую модель программно.
Смоделируйте трассу регуляции генов
В этом примере показано, как создать простую модель регуляции генов и симулировать ее.
Создайте и симулируйте модель с пользовательской функцией
В этом примере показано, как создать пользовательскую функцию и включить ее в симуляцию модели.
Задайте скорости реакции с кинетикой действующих масс
Используйте кинетику действующих масс, чтобы задать нулевой порядок, первый порядок, и обратимые реакции второго порядка.
Задайте скорости реакции с кинетикой фермента
Используйте дифференциальные уравнения, кинетику действующих масс или кинетику Михаэлиса-Ментен, для определения ферментативных реакций.
В SimBiology событие является дискретным переходом в значении количества или выражения в модели.
Создайте фармакокинетические модели
SimBiology позволяет вам создать один - 2D, или мультиотсек фармакокинетические модели для оценки параметра и симуляции модели.
SimBiology® модель является динамической системой, описанной набором количеств и математических выражений.
A species object представляет разновидность, которая является количеством химиката или сущности, которая участвует в реакциях.
Используйте дозы, чтобы смоделировать различные режимы дозирования.
Используйте варианты, чтобы сохранить альтернативные значения параметров и начальные условия модели.
Определения и оценки правил в моделях SimBiology
Правила являются математическими выражениями, которые позволяют вам задавать или изменять количества модели, а именно, способность отсека, сумма разновидностей или значение параметров.
Определения и оценки реакций в моделях SimBiology
Реакция является математическим выражением, которые описывают преобразование, транспорт или процесс привязки, который изменяет одну или несколько разновидностей.