Возвратите кодон нуклеотида в отображение аминокислоты для генетического кода
Map
= geneticcode
Map
= geneticcode(GeneticCode
)
GeneticCode | Целое число, вектор символов или строка, задающая номер генетического кода или кодовое название из таблицы Genetic Code. Значением по умолчанию является СоветЕсли вы используете кодовое название, можно обрезать имя к первым двум буквам имени. |
Map | Структура, содержащая отображение кодонов нуклеотида к аминокислотам для стандартного генетического кода. Структура Map содержит поле для каждого кодона нуклеотида. |
возвращает структуру, содержащую отображение кодонов нуклеотида к аминокислотам для стандартного генетического кода. Структура Map
= geneticcodeMap
содержит поле для каждого кодона нуклеотида.
возвращает структуру, содержащую отображение кодонов нуклеотида к аминокислотам для заданного генетического кода. Map
= geneticcode(GeneticCode
)GeneticCode
также:
Целое число, вектор символов или строка, задающая номер кода или кодовое название из таблицы Genetic Code
transl_table
(код) номер от веб-страницы NCBI, описывающей генетические коды:
Если вы используете кодовое название, можно обрезать имя к первым двум буквам имени.
Генетический код
Номер кода | Кодовое название |
---|---|
1 | Standard |
2 | Vertebrate Mitochondrial |
3 | Yeast Mitochondrial |
4 | Mold , Protozoan , Coelenterate Mitochondrial и Mycoplasma/Spiroplasma |
5 | Invertebrate Mitochondrial |
6 | Ciliate , Dasycladacean и Hexamita Nuclear |
9 | Echinoderm Mitochondrial |
10 | Euplotid Nuclear |
11 | Bacterial и Plant Plastid |
12 | Alternative Yeast Nuclear |
13 | Ascidian Mitochondrial |
14 | Flatworm Mitochondrial |
15 | Blepharisma Nuclear |
16 | Chlorophycean Mitochondrial |
21 | Trematode Mitochondrial |
22 | Scenedesmus Obliquus Mitochondrial |
23 | Thraustochytrium Mitochondrial |
Возвратите отображение кодонов нуклеотида к аминокислотам для Плоского червя Митохондриальный генетический код.
wormmap = geneticcode('Flatworm Mitochondrial');
[1] Веб-страница NCBI, описывающая генетические коды:
aa2nt
| aminolookup
| baselookup
| codonbias
| dnds
| dndsml
| nt2aa
| revgeneticcode
| seqshoworfs
| seqviewer