оценка

Подходящие параметры Байесовой модели линейной регрессии к данным

Чтобы выполнить выбор переменной прогноза для Байесовой модели линейной регрессии, смотрите estimate.

Синтаксис

PosteriorMdl = estimate(PriorMdl,X,y)
PosteriorMdl = estimate(PriorMdl,X,y,Name,Value)
[PosteriorMdl,estBeta,EstBetaCov,estSigma2,estSigma2Var] = estimate(___)
[PosteriorMdl,estBeta,EstBetaCov,estSigma2,estSigma2Var,Summary] = estimate(___)

Описание

пример

PosteriorMdl = estimate(PriorMdl,X,y) возвращает модель, которая характеризует объединенные апостериорные распределения β и σ 2 из Байесовой модели линейной регрессии. PriorMdl задает объединенное предшествующее распределение параметров и структуру модели линейной регрессии. X является данными о предикторе, и y является данными об ответе. PriorMdl и PosteriorMdl не могут быть тем же типом объекта.

Чтобы произвести PosteriorMdl, функция estimate обновляет предшествующее распределение с информацией о параметрах, которые это получает из данных.

NaN s в данных указывает на отсутствующие значения, которые estimate удаляет при помощи мудрого списком удаления.

пример

PosteriorMdl = estimate(PriorMdl,X,y,Name,Value) дополнительные опции использования заданы одним или несколькими аргументами пары "имя-значение". Например, можно задать значение для одного из β или σ 2, чтобы оценить апостериорное распределение conditional одного параметра, учитывая заданное значение другого параметра.

Если вы задаете Beta или Sigma2, то PosteriorMdl и PriorMdl равны.

пример

Примечание

Следующие два синтаксиса будут удалены в будущем релизе. Для получения дополнительной информации см. Вопросы совместимости.

[PosteriorMdl,estBeta,EstBetaCov,estSigma2,estSigma2Var] = estimate(___) использование любая из комбинаций входных аргументов в предыдущих синтаксисах, чтобы возвратиться:

  • estBeta — Предполагаемые коэффициенты регрессии, то есть, средний вектор апостериорного распределения β

  • EstBetaCov — Предполагаемая ковариационная матрица содействующих оценок, то есть, ковариационная матрица апостериорного распределения β

  • EstSigma2 — Предполагаемое отклонение воздействия, то есть, среднее значение апостериорного распределения σ 2

  • EstSigma2Var — Предполагаемое отклонение отклонения воздействия, то есть, отклонения апостериорного распределения σ 2

Если вы задаете Beta или Sigma2, то estimate возвращает условные следующие оценки. В противном случае estimate возвращает объединенные следующие оценки.

пример

[PosteriorMdl,estBeta,EstBetaCov,estSigma2,estSigma2Var,Summary] = estimate(___) также возвращает таблицу, которая содержит следующее для каждого параметра: следующие средние значения и стандартные отклонения, 95%-е вероятные интервалы, апостериорная вероятность, что параметр больше, чем 0, и описание апостериорного распределения (если вы существуете).

Примеры

свернуть все

Рассмотрите модель, которая предсказывает экономию топлива (в MPG) автомобиля, учитывая его объем двигателя и вес.

Загрузите набор данных carsmall.

load carsmall
x = [Displacement Weight];
y = MPG;

Экономия топлива регресса на объем двигателя и вес, включая прерывание, чтобы получить оценки обычных наименьших квадратов (OLS).

Mdl = fitlm(x,y)
Mdl = 
Linear regression model:
    y ~ 1 + x1 + x2

Estimated Coefficients:
                    Estimate        SE         tStat       pValue  
                   __________    _________    _______    __________

    (Intercept)        46.925       2.0858     22.497    6.0509e-39
    x1              -0.014593    0.0082695    -1.7647      0.080968
    x2             -0.0068422    0.0011337    -6.0353    3.3838e-08


Number of observations: 94, Error degrees of freedom: 91
Root Mean Squared Error: 4.09
R-squared: 0.747,  Adjusted R-Squared: 0.741
F-statistic vs. constant model: 134, p-value = 7.22e-28
Mdl.MSE
ans = 16.7100

Создайте значение по умолчанию, рассейте предшествующее распределение для одного предиктора.

p = 2;
PriorMdl = bayeslm(p);

PriorMdl является объектом модели diffuseblm.

Используйте опции по умолчанию, чтобы оценить апостериорное распределение.

PosteriorMdl = estimate(PriorMdl,x,y);
Method: Analytic posterior distributions
Number of observations: 94
Number of predictors:   3
 
           |   Mean     Std         CI95        Positive       Distribution     
--------------------------------------------------------------------------------
 Intercept | 46.9247  2.1091  [42.782, 51.068]    1.000   t (46.92, 2.09^2, 91) 
 Beta(1)   | -0.0146  0.0084  [-0.031,  0.002]    0.040   t (-0.01, 0.01^2, 91) 
 Beta(2)   | -0.0068  0.0011  [-0.009, -0.005]    0.000   t (-0.01, 0.00^2, 91) 
 Sigma2    | 17.0855  2.5905  [12.748, 22.866]    1.000   IG(45.50, 0.0013)     
 

PosteriorMdl является объектом модели conjugateblm.

Следующие средние значения и содействующие оценки OLS почти идентичны. Кроме того, следующие стандартные отклонения и стандартные погрешности OLS почти идентичны. Следующее среднее значение Sigma2 близко к среднеквадратической ошибке (MSE) OLS.

Считайте несколько моделью линейной регрессии, которая предсказывает США действительный валовой национальный продукт (GNPR) с помощью линейной комбинации индекса промышленного производства (IPI), общая занятость (E) и действительная заработная плата (WR).

Для всех, серия независимых Гауссовых воздействий со средним значением 0 и отклонение. Примите эти предшествующие дистрибутивы:

  • 4-D t распределение с 30 степенями свободы для каждого компонента, корреляционная матрица C, местоположение ct и шкала st.

  • , с формой и шкалой.

bayeslm обрабатывает эти предположения и вероятность данных, как будто следующее соответствие аналитически тяжело.

Объявите функцию MATLAB® что:

  • Принимает значения и вместе в вектор-столбце и принимает значения гиперпараметров

  • Возвращает значение объединенного предшествующего распределения, учитывая значения и

function logPDF = priorMVTIG(params,ct,st,dof,C,a,b)
%priorMVTIG Log density of multivariate t times inverse gamma 
%   priorMVTIG passes params(1:end-1) to the multivariate t density
%   function with dof degrees of freedom for each component and positive
%   definite correlation matrix C. priorMVTIG returns the log of the product of
%   the two evaluated densities.
%   
%   params: Parameter values at which the densities are evaluated, an
%           m-by-1 numeric vector.
%
%       ct: Multivariate t distribution component centers, an (m-1)-by-1
%           numeric vector.  Elements correspond to the first m-1 elements
%           of params.
%
%       st: Multivariate t distribution component scales, an (m-1)-by-1
%           numeric (m-1)-by-1 numeric vector.  Elements correspond to the
%           first m-1 elements of params.
%
%      dof: Degrees of freedom for the multivariate t distribution, a
%           numeric scalar or (m-1)-by-1 numeric vector. priorMVTIG expands
%           scalars such that dof = dof*ones(m-1,1). Elements of dof
%           correspond to the elements of params(1:end-1).
%
%        C: Correlation matrix for the multivariate t distribution, an
%           (m-1)-by-(m-1) symmetric, positive definite matrix. Rows and
%           columns correspond to the elements of params(1:end-1).
% 
%        a: Inverse gamma shape parameter, a positive numeric scalar.
%
%        b: Inverse gamma scale parameter, a positive scalar.
%
beta = params(1:(end-1));
sigma2 = params(end);

tVal = (beta - ct)./st;
mvtDensity = mvtpdf(tVal,C,dof);
igDensity = sigma2^(-a-1)*exp(-1/(sigma2*b))/(gamma(a)*b^a);

logPDF = log(mvtDensity*igDensity);
end


Создайте анонимную функцию, которая действует как priorMVTIG, но принимает значения параметров только и содержит гиперзначения параметров, зафиксированные к произвольно выбранным значениям.

rng(1); % For reproducibility
dof = 30;
V = rand(4,4);
Sigma = V'*V;
st = sqrt(diag(Sigma));
C = Sigma./(st*st');
ct = -10*rand(4,1);
a = 10*rand;
b = 10*rand;
logPDF = @(params)priorMVTIG(params,ct,st,dof,C,a,b);

Создайте пользовательскую объединенную предшествующую модель для параметров линейной регрессии. Задайте количество предикторов p. Кроме того, задайте указатель на функцию для priorMVTIG и имен переменных.

p = 3;
PriorMdl = bayeslm(p,'ModelType','custom','LogPDF',logPDF,...
    'VarNames',["IPI" "E" "WR"]);

PriorMdl является customblm Байесов объект модели линейной регрессии, представляющий предшествующее распределение отклонения воздействия и коэффициентов регрессии.

Загрузите набор данных Нельсона-Плоссера. Создайте переменные для ряда предиктора и ответа.

load Data_NelsonPlosser
X = DataTable{:,PriorMdl.VarNames(2:end)};
y = DataTable{:,'GNPR'};

Оцените крайние апостериорные распределения и использование сэмплера Гамильтонова Монте-Карло (HMC). Задайте выборки рисунка 10,000, и электротермотренировка 1 000 чертит.

PosteriorMdl = estimate(PriorMdl,X,y,'Sampler','hmc','NumDraws',1e4,...
    'Burnin',1e3);
Method: MCMC sampling with 10000 draws
Number of observations: 62
Number of predictors:   4
 
           |   Mean      Std          CI95         Positive  Distribution 
--------------------------------------------------------------------------
 Intercept | -23.8681  3.1357  [-30.155, -17.617]    0.000     Empirical  
 IPI       |   4.3819  0.1089   [ 4.165,  4.596]     1.000     Empirical  
 E         |   0.0011  0.0002   [ 0.001,  0.002]     1.000     Empirical  
 WR        |   2.4998  0.3355   [ 1.849,  3.167]     1.000     Empirical  
 Sigma2    |  39.9245  6.7843   [28.684, 55.345]     1.000     Empirical  
 

PosteriorMdl является объектом модели empiricalblm, хранящим ничьи от апостериорных распределений.

Просмотрите график трассировки и график ACF ничьих от следующего из (например), и отклонение воздействия. Не стройте электротермотренировку.

figure;
subplot(2,1,1)
plot(PosteriorMdl.BetaDraws(2,1001:end));
title(['Trace Plot ' char(8212) ' \beta_1']);
xlabel('MCMC Draw')
ylabel('Simulation Index')
subplot(2,1,2)
autocorr(PosteriorMdl.BetaDraws(2,1001:end))

figure;
subplot(2,1,1)
plot(PosteriorMdl.Sigma2Draws(1001:end));
title(['Trace Plot ' char(8212) ' Disturbance Variance']);
xlabel('MCMC Draw')
ylabel('Simulation Index')
subplot(2,1,2)
autocorr(PosteriorMdl.Sigma2Draws(1001:end))

Выборка MCMC отклонения воздействия, кажется, смешивается хорошо.

Считайте модель регрессии в Оценке Следующей Используя гамильтонов Сэмплер Монте-Карло. Этот пример использует те же данные и контекст, но принимает рассеянную предшествующую модель вместо этого.

Создайте рассеянную предшествующую модель для параметров линейной регрессии. Задайте количество предикторов p и имена коэффициентов регрессии.

p = 3;
PriorMdl = bayeslm(p,'ModelType','diffuse','VarNames',["IPI" "E" "WR"])
PriorMdl = 
  diffuseblm with properties:

    NumPredictors: 3
        Intercept: 1
         VarNames: {4x1 cell}

 
           | Mean  Std        CI95        Positive        Distribution       
-----------------------------------------------------------------------------
 Intercept |  0    Inf  [   NaN,    NaN]    0.500   Proportional to one      
 IPI       |  0    Inf  [   NaN,    NaN]    0.500   Proportional to one      
 E         |  0    Inf  [   NaN,    NaN]    0.500   Proportional to one      
 WR        |  0    Inf  [   NaN,    NaN]    0.500   Proportional to one      
 Sigma2    |  Inf  Inf  [   NaN,    NaN]    1.000   Proportional to 1/Sigma2 
 

PriorMdl является объектом модели diffuseblm.

Загрузите набор данных Нельсона-Плоссера. Создайте переменные для ряда предиктора и ответа.

load Data_NelsonPlosser
X = DataTable{:,PriorMdl.VarNames(2:end)};
y = DataTable{:,'GNPR'};

Оцените условные апостериорные распределения β учитывая данные и это σ2=2.

[Mdl,condPostMeanBeta,CondPostCovBeta] = estimate(PriorMdl,X,y,...
    'Sigma2',2);
Method: Analytic posterior distributions
Conditional variable: Sigma2 fixed at   2
Number of observations: 62
Number of predictors:   4
 
           |   Mean      Std          CI95         Positive     Distribution    
--------------------------------------------------------------------------------
 Intercept | -24.2536  1.8696  [-27.918, -20.589]    0.000   N (-24.25, 1.87^2) 
 IPI       |   4.3913  0.0301   [ 4.332,  4.450]     1.000   N (4.39, 0.03^2)   
 E         |   0.0011  0.0001   [ 0.001,  0.001]     1.000   N (0.00, 0.00^2)   
 WR        |   2.4682  0.0743   [ 2.323,  2.614]     1.000   N (2.47, 0.07^2)   
 Sigma2    |    2       0       [ 2.000,  2.000]     1.000   Fixed value        
 
Warning: Current syntax supports 6 output arguments, and will be removed in a future release. For supported output arguments, see <a href="matlab:helpview(fullfile(docroot,'econ','econ.map'),'blmestimate')">estimate</a>.

estimate возвращается 4 1 вектор средних значений (condPostMeanBeta) и ковариационная матрица 4 на 4 (CondPostCovBeta) условного апостериорного распределения β учитывая, что данные и это σ2=2. Кроме того, estimate отображает сводные данные условного апостериорного распределения β. Поскольку σ2 фиксируется во время оценки, выводы на ней тривиальны.

Предупреждение указывает, что в будущем релизе синтаксисы estimate изменятся. В это время не обновляйте свой код. Для получения дополнительной информации смотрите Заменяющий Нежелательные Синтаксисы оценки.

Отобразите Mdl.

Mdl
Mdl = 
  diffuseblm with properties:

    NumPredictors: 3
        Intercept: 1
         VarNames: {4x1 cell}

 
           | Mean  Std        CI95        Positive        Distribution       
-----------------------------------------------------------------------------
 Intercept |  0    Inf  [   NaN,    NaN]    0.500   Proportional to one      
 IPI       |  0    Inf  [   NaN,    NaN]    0.500   Proportional to one      
 E         |  0    Inf  [   NaN,    NaN]    0.500   Proportional to one      
 WR        |  0    Inf  [   NaN,    NaN]    0.500   Proportional to one      
 Sigma2    |  Inf  Inf  [   NaN,    NaN]    1.000   Proportional to 1/Sigma2 
 

Поскольку estimate вычисляет условное апостериорное распределение, он возвращает исходную предшествующую модель, не следующее, в первом положении списка выходных аргументов.

Оцените условные апостериорные распределения σ2 учитывая, что β condPostMeanBeta.

[~,~,~,condPostMeanSigma2,condPostVarSigma2] = estimate(PriorMdl,X,y,...
    'Beta',condPostMeanBeta);
Method: Analytic posterior distributions
Conditional variable: Beta fixed at -24.2536       4.3913   0.00112035      2.46823
Number of observations: 62
Number of predictors:   4
 
           |   Mean      Std          CI95         Positive     Distribution    
--------------------------------------------------------------------------------
 Intercept | -24.2536   0      [-24.254, -24.254]    0.000   Fixed value        
 IPI       |   4.3913   0       [ 4.391,  4.391]     1.000   Fixed value        
 E         |   0.0011   0       [ 0.001,  0.001]     1.000   Fixed value        
 WR        |   2.4682   0       [ 2.468,  2.468]     1.000   Fixed value        
 Sigma2    |  48.5138  9.0088   [33.984, 69.098]     1.000   IG(31.00, 0.00069) 
 
Warning: Current syntax supports 6 output arguments, and will be removed in a future release. For supported output arguments, see <a href="matlab:helpview(fullfile(docroot,'econ','econ.map'),'blmestimate')">estimate</a>.

estimate возвращает среднее значение (condPostMeanSigma2) и отклонение (CondPostVarSigma2) условного апостериорного распределения σ2 учитывая данные и это β condPostMeanBeta. В отображении, выводах на β тривиальны.

Считайте модель регрессии в Оценке Следующей Используя гамильтонов Сэмплер Монте-Карло. Этот пример использует те же данные и контекст, но принимает полусопряженную предшествующую модель вместо этого.

Создайте полусопряженную предшествующую модель для параметров линейной регрессии. Задайте количество предикторов p и имена коэффициентов регрессии.

p = 3;
PriorMdl = bayeslm(p,'ModelType','semiconjugate',...
    'VarNames',["IPI" "E" "WR"]);

PriorMdl является объектом модели semiconjugateblm.

Загрузите набор данных Нельсона-Плоссера. Создайте переменные для ряда предиктора и ответа.

load Data_NelsonPlosser
X = DataTable{:,PriorMdl.VarNames(2:end)};
y = DataTable{:,'GNPR'};

Оцените крайние апостериорные распределения β и σ2. Затем получите сводную таблицу оценки:

  1. Передача следующей модели к summarize

  2. Извлечение поля MarginalDistributions из возвращенных сводных данных

rng(1); % For reproducibility
PosteriorMdl = estimate(PriorMdl,X,y);
Method: Gibbs sampling with 10000 draws
Number of observations: 62
Number of predictors:   4
 
           |   Mean      Std          CI95        Positive  Distribution 
-------------------------------------------------------------------------
 Intercept | -23.9922  9.0520  [-41.734, -6.198]    0.005     Empirical  
 IPI       |   4.3929  0.1458   [ 4.101,  4.678]    1.000     Empirical  
 E         |   0.0011  0.0003   [ 0.000,  0.002]    0.999     Empirical  
 WR        |   2.4711  0.3576   [ 1.762,  3.178]    1.000     Empirical  
 Sigma2    |  46.7474  8.4550   [33.099, 66.126]    1.000     Empirical  
 
Summary = summarize(PosteriorMdl);
Summary = Summary.MarginalDistributions;

PosteriorMdl является объектом модели empiricalblm, потому что крайние апостериорные распределения полусопряженных моделей аналитически тяжелы, таким образом, estimate должен реализовать сэмплер Гиббса. Summary является таблицей, содержащей оценки, и заключает тот estimate отображения в командной строке.

Отобразите сводную таблицу.

Summary
Summary=5×5 table
                   Mean          Std                  CI95              Positive    Distribution
                 _________    __________    ________________________    ________    ____________

    Intercept      -23.992         9.052       -41.734       -6.1976     0.0053     'Empirical' 
    IPI             4.3929       0.14578        4.1011        4.6782          1     'Empirical' 
    E            0.0011124    0.00033976    0.00045128     0.0017883     0.9989     'Empirical' 
    WR              2.4711        0.3576        1.7622        3.1781          1     'Empirical' 
    Sigma2          46.747         8.455        33.099        66.126          1     'Empirical' 

Доступ к 95% equitailed вероятный интервал коэффициента регрессии IPI.

Summary.CI95(2,:)
ans = 1×2

    4.1011    4.6782

Входные параметры

свернуть все

Байесова модель линейной регрессии представление предшествующей модели, заданной как объект в этой таблице.

Объект моделиОписание
conjugateblmЗависимый, нормальная обратная гамма спрягает модель, возвращенную bayeslm или estimate
semiconjugateblmНезависимый, нормальная обратная гамма полуспрягает модель, возвращенную bayeslm
diffuseblmРассейте предшествующую модель, возвращенную bayeslm
empiricalblmПредшествующая модель, охарактеризованная выборками от предшествующих дистрибутивов, возвращенных bayeslm или estimate
customblmПредшествующая функция распределения, которую вы объявляете возвращенный bayeslm

PriorMdl может также представлять объединенную следующую модель, возвращенную estimate, или conjugateblm или объект модели empiricalblm. В этом случае estimate обновляет объединенное апостериорное распределение с помощью новых наблюдений в X и y.

Данные о предикторе для нескольких модель линейной регрессии, заданная как numObservations-by-PriorMdl.NumPredictors числовая матрица. numObservations является количеством наблюдений и должен быть равен длине y.

Типы данных: double

Данные об ответе для нескольких модель линейной регрессии, заданная как числовой вектор с элементами numObservations.

Типы данных: double

Аргументы в виде пар имя-значение

Укажите необязательные аргументы в виде пар ""имя, значение"", разделенных запятыми. Имя (Name) — это имя аргумента, а значение (Value) — соответствующее значение. Name должен появиться в кавычках. Вы можете задать несколько аргументов в виде пар имен и значений в любом порядке, например: Name1, Value1, ..., NameN, ValueN.

Пример: 'Sigma2',2 задает оценку условного апостериорного распределения коэффициентов регрессии, учитывая данные и что заданным отклонением воздействия является 2.

Опции для всех предшествующих дистрибутивов

свернуть все

Отметьте, чтобы отобразить Байесовы сводные данные средства оценки в командной строке, заданной как пара, разделенная запятой, состоящая из 'Display' и значения в этой таблице.

ЗначениеОписание
trueestimate распечатывает информацию об оценке и таблицу, обобщающую Байесовы средства оценки к командной строке.
falseestimate не распечатывает к командной строке.

Информация об оценке включает метод оценки, зафиксированные параметры, количество наблюдений и количество предикторов. Сводная таблица содержит оцененные следующие средние значения и стандартные отклонения (квадратный корень из следующего отклонения), 95% equitailed вероятные интервалы, апостериорная вероятность, что параметр больше, чем 0, и описание апостериорного распределения (если известный).

Если вы задаете один из Beta или Sigma2, то estimate включает вашу спецификацию в отображение, и соответствующие следующие оценки тривиальны.

Пример: 'Display',false

Типы данных: логический

Опции для всех предшествующих дистрибутивов кроме эмпирического

свернуть все

Значение коэффициентов регрессии для условной оценки апостериорного распределения отклонения воздействия, заданного как пара, разделенная запятой, состоящая из 'Beta' и (PriorMdl.Intercept + PriorMdl.NumPredictors)-by-1 числовой вектор. estimate оценивает характеристики π (σ 2|y, X, β = Beta), где y является y, X является X, и Beta является значением 'Beta'. Если PriorMdl.Intercept является true, то Beta(1) соответствует образцовому прерыванию. Все другие значения соответствуют переменным прогноза, которые составляют столбцы X. Beta не может содержать значения NaN (то есть, все коэффициенты должны быть известны).

Вы не можете задать Beta и Sigma2 одновременно.

По умолчанию estimate не вычисляет характеристики условного выражения, следующего из σ 2.

Пример: 'Beta',1:3

Типы данных: double

Значение отклонения воздействия для условной оценки апостериорного распределения коэффициентов регрессии, заданных как пара, разделенная запятой, состоящая из 'Sigma2' и положительного числового скаляра. estimate оценивает характеристики π (β |y, X, Sigma2), где y является y, X является X, и Sigma2 является значением 'Sigma2'.

Вы не можете задать Sigma2 и Beta одновременно.

По умолчанию estimate не вычисляет характеристики условного выражения, следующего из β.

Пример: 'Sigma2',1

Типы данных: double

Опции для полусопряженных, эмпирических, и пользовательских предшествующих дистрибутивов

свернуть все

Симуляция Монте-Карло настроила объем выборки, заданный как пара, разделенная запятой, состоящая из 'NumDraws' и положительного целого числа. estimate на самом деле чертит BurnIn – выборки NumDraws* Thin. Поэтому estimate основывает оценки от выборок NumDraws. Для получения дополнительной информации о том, как estimate уменьшает полную выборку Монте-Карло, см. Алгоритмы.

Если PriorMdl является моделью semiconjugateblm, и вы задаете Beta или Sigma2, то MATLAB® игнорирует NumDraws.

Пример: 'NumDraws',1e7

Типы данных: double

Опции для полусопряженных и пользовательских предшествующих дистрибутивов

свернуть все

Количество ничьих, чтобы удалить с начала выборки Монте-Карло уменьшать переходные эффекты, заданные как пара, разделенная запятой, состоящая из 'BurnIn' и неотрицательного скаляра. Для получения дополнительной информации о том, как estimate уменьшает полную выборку Монте-Карло, см. Алгоритмы.

Совет

Чтобы помочь вам задать соответствующий размер электротермотренировки, определите степень переходного поведения в выборке Монте-Карло путем определения 'BurnIn',0, симуляции нескольких тысяч наблюдений с помощью simulate, и затем строя пути.

Пример: 'BurnIn',0

Типы данных: double

Монте-Карло настроил множитель объема выборки, заданный как пара, разделенная запятой, состоящая из 'Thin' и положительного целого числа.

Фактическим объемом выборки Монте-Карло является BurnIn + NumDraws *Thin. После отбрасывания выжигания дефектов estimate отбрасывает каждый Thin1 чертит, и затем сохраняет следующее. Для получения дополнительной информации о том, как estimate уменьшает полную выборку Монте-Карло, см. Алгоритмы.

Совет

Чтобы уменьшать потенциальную большую последовательную корреляцию в выборке Монте-Карло или уменьшать потребление памяти ничьих, сохраненных в PosteriorMdl, задают большое значение для Thin.

Пример: 'Thin',5

Типы данных: double

Начальные значения коэффициентов регрессии для выборки Цепи Маркова Монте-Карло (MCMC), заданной как пара, разделенная запятой, состоящая из 'BetaStart' и числового вектор-столбца с (PriorMdl.Intercept + PriorMdl.NumPredictors) элементы. По умолчанию BetaStart является оценкой обычных наименьших квадратов (OLS).

Совет

Хорошая практика должна запустить estimate многократно с помощью различных начальных значений параметра. Проверьте, что решения от каждого выполнения сходятся к подобным значениям.

Пример: 'BetaStart',[1; 2; 3]

Типы данных: double

Начальные значения отклонения воздействия для выборки MCMC, заданной как пара, разделенная запятой, состоящая из 'Sigma2Start' и положительного числового скаляра. По умолчанию Sigma2Start является остаточной среднеквадратической ошибкой OLS.

Совет

Хорошая практика должна запустить estimate многократно с помощью различных начальных значений параметра. Проверьте, что решения от каждого выполнения сходятся к подобным значениям.

Пример: 'Sigma2Start',4

Типы данных: double

Опции для пользовательских предшествующих дистрибутивов

свернуть все

Репараметризация σ 2 как журнал (σ 2) во время следующей оценки и симуляции, заданной как пара, разделенная запятой, состоящая из 'Reparameterize' и значения в этой таблице.

ЗначениеОписание
falseestimate не повторно параметризовал σ 2.
trueestimate повторно параметризовал σ 2 как журнал (σ 2). estimate преобразовывает результаты назад в исходную шкалу и не изменяет функциональную форму PriorMdl.LogPDF.

Совет

Если вы испытываете числовую нестабильность во время следующей оценки или симуляции σ 2, то задаете 'Reparameterize',true.

Пример: 'Reparameterize',true

Типы данных: логический

Сэмплер MCMC, заданный как пара, разделенная запятой, состоящая из 'Sampler' и значения в этой таблице.

ЗначениеОписание
'slice'Сэмплер среза
'metropolis'Случайный сэмплер Столицы обхода
'hmc'Сэмплер Гамильтонова Монте-Карло (HMC)

Совет

  • Увеличить качество MCMC чертит, настройте сэмплер.

    1. Прежде, чем вызвать estimate, задайте настраивающиеся параметры и их значения при помощи sampleroptions. Например, чтобы задать ширину сэмплера среза width, используйте:

      options = sampleroptions('Sampler',"slice",'Width',width);

    2. Задайте объект, содержащий настраивающиеся спецификации параметра, возвращенные sampleroptions при помощи аргумента пары "имя-значение" 'Options'. Например, чтобы использовать настраивающиеся спецификации параметра в options, задайте:

      'Options',options

  • Если вы задаете сэмплер HMC, то лучшая практика состоит в том, чтобы обеспечить градиент для некоторых переменных, по крайней мере. estimate обращается численный расчет любых недостающих частных производных (значения NaN) в векторе градиента.

Пример: 'Sampler',"hmc"

Типы данных: string

Опции сэмплера, заданные как пара, разделенная запятой, состоящая из 'Options' и массива структур, возвращенного sampleroptions. Используйте 'Options', чтобы задать сэмплер MCMC и его настраивающие значения параметров.

Пример: 'Options',sampleroptions('Sampler',"hmc")

Типы данных: struct

Типичная ширина интервала выборки вокруг текущего значения в предельных распределениях для сэмплера среза, заданного как пара, разделенная запятой, состоящая из 'Width' и положительного числового скаляра или (PriorMdl.Intercept + PriorMdl.NumPredictors + 1)-by-1 числовой вектор положительных значений. Первый элемент соответствует образцовому прерыванию, если вы существуете в модели. Следующие элементы PriorMdl.NumPredictors соответствуют коэффициентам переменных прогноза, упорядоченных столбцами данных предиктора. Последний элемент соответствует образцовому отклонению.

  • Если Width является скаляром, то estimate применяет Width ко всему PriorMdl.NumPredictors + PriorMdl.Intercept + предельные распределения 1.

  • Если Width является числовым вектором, то estimate применяет первый элемент к прерыванию (если вы существуете), следующие элементы PriorMdl.NumPredictors к коэффициентам регрессии, соответствующим переменным прогноза в X и последнему элементу к отклонению воздействия.

  • Если объем выборки (size(X,1)) является меньше чем 100, то Width является 10 по умолчанию.

  • Если объем выборки - по крайней мере 100, то estimate устанавливает Width на вектор соответствующих следующих стандартных отклонений по умолчанию, принимая рассеянную предшествующую модель (diffuseblm).

Типичная ширина сэмплера среза не влияет на сходимость выборки MCMC. Это действительно влияет на количество необходимых функциональных оценок, то есть, эффективности алгоритма. Если ширина слишком мала, то алгоритм может реализовать чрезмерное количество функциональных оценок, чтобы определить соответствующую ширину выборки. Если ширина является слишком большой, то алгоритму придется уменьшить ширину к соответствующему размеру, который требует функциональных оценок.

estimate отправляет Width в функцию slicesample. Для получения дополнительной информации смотрите slicesample.

Совет

  • Для максимальной гибкости задайте ширину сэмплера среза width при помощи аргумента пары "имя-значение" 'Options'. Например:

    'Options',sampleroptions('Sampler',"slice",'Width',width)

Пример: 'Width',[100*ones(3,1);10]

Выходные аргументы

свернуть все

Байесова модель линейной регрессии хранение характеристик распределения, возвращенных как conjugateblm, semiconjugateblm, diffuseblm, empiricalblm или объект модели customblm.

  • Если вы не задаете или Beta или Sigma2 (их значениями является []), то estimate обновляет предшествующую модель с помощью вероятности данных, чтобы сформировать апостериорное распределение. PosteriorMdl характеризует апостериорное распределение. Его тип объекта зависит от предшествующего типа модели (PriorMdl).

    Объект моделиPriorMdl
    conjugateblm conjugateblm или diffuseblm
    empiricalblm semiconjugateblm, empiricalblm или customblm

  • Если вы задаете или Beta или Sigma2, то PosteriorMdl равняется PriorMdl (эти две модели являются тем же объектом, хранящим те же значения свойств). estimate не обновляет предшествующую модель, чтобы сформировать следующую модель. Однако estBeta, EstBetaCov, estSigma2, estSigma2Var и Summary хранят условные следующие оценки.

Для получения дополнительной информации на отображении PosteriorMdl, смотрите Summary.

Для получения дополнительной информации на поддерживаемых апостериорных распределениях, которые аналитически послушны, смотрите Аналитически Послушное Последующее поколение.

Предполагаемое следующее среднее значение коэффициентов регрессии, возвращенных как числовой вектор-столбец размера PriorMdl.Intercept + PriorMdl.NumPredictors.

Если PriorMdl.Intercept является true, то estBeta(1) является предполагаемым прерыванием, и все другие элементы соответствуют столбцам X. В противном случае элементы соответствуют столбцам X.

Если вы не задаете Sigma2, то estBeta является предполагаемым средним значением крайнего апостериорного распределения β. В противном случае это - предполагаемое среднее значение условного апостериорного распределения β, данного Sigma2 и данные.

Если вы задаете Beta, то estBeta равняется Beta.

Примечание

estimate не возвратит estBeta в будущем релизе. Для получения дополнительной информации см. Вопросы совместимости.

Предполагаемая следующая ковариационная матрица коэффициентов регрессии, возвращенных как (PriorMdl.Intercept + PriorMdl.NumPredictors) (PriorMdl.Intercept + PriorMdl.NumPredictors) числовая матрица. Строки и столбцы EstBetaCov, соответствуют элементам estBeta.

Если вы не задаете Sigma2, то EstBetaCov является предполагаемой ковариационной матрицей крайнего апостериорного распределения β. В противном случае это - предполагаемая ковариационная матрица условного апостериорного распределения β, учитывая данные и что σ 2 = Sigma2.

Если вы задаете Beta, то EstBetaCov является матрицей нулей.

Примечание

estimate не возвратит EstBetaCov в будущем релизе. Для получения дополнительной информации см. Вопросы совместимости.

Предполагаемое следующее среднее значение дисперсии воздействия, возвращенной в виде положительного числа.

Если вы не задаете Beta, то estSigma2 является предполагаемым средним значением крайнего апостериорного распределения σ 2. В противном случае это - предполагаемое среднее значение условного апостериорного распределения σ 2, учитывая данные и тот β = Beta.

Если вы задаете Sigma2, то estSigma2 равняется Sigma2.

Примечание

estimate не возвратит estSigma2 в будущем релизе. Для получения дополнительной информации см. Вопросы совместимости.

Предполагаемое следующее отклонение дисперсии воздействия, возвращенной в виде числа.

Если вы не задаете Beta, то estSigma2Var является предполагаемым отклонением крайнего апостериорного распределения σ 2. В противном случае это - предполагаемая ковариационная матрица условного апостериорного распределения σ 2, учитывая данные и тот β = Beta.

Если вы задаете Sigma2, то estSigma2Var является 0.

Примечание

estimate не возвратит estSigma2Var в будущем релизе. Для получения дополнительной информации см. Вопросы совместимости.

Сводные данные Байесовых средств оценки, возвращенных как таблица. Summary содержит ту же информацию как отображение сводных данных оценки (Display). Строки соответствуют параметрам, и столбцы соответствуют этим следующим характеристикам:

  • Среднее значение Следующее среднее значение

  • Станд Следующее стандартное отклонение

  • CI95 – 95% equitailed вероятный интервал

  • Positive – Апостериорная вероятность, что параметр больше, чем 0

  • Distribution – Описание крайнего или условного апостериорного распределения параметра, когда известный

  • Covariances – Предполагаемая ковариационная матрица коэффициентов и отклонения воздействия

Имена строки являются именами в PriorMdl.VarNames. Именем последней строки является Sigma2.

Также передайте PosteriorMdl summarize, чтобы получить сводные данные Байесовых средств оценки.

Примечание

estimate возвратит Summary во втором выходном положении в будущем релизе. Для получения дополнительной информации см. Вопросы совместимости.

Ограничения

Если PriorMdl является объектом модели empiricalblm. Вы не можете задать Beta или Sigma2. Вы не можете оценить условные апостериорные распределения при помощи эмпирического предшествующего распределения.

Больше о

свернуть все

Байесова модель линейной регрессии

Bayesian linear regression model обрабатывает параметры β и σ 2 в модели yt нескольких линейных регрессий (MLR) = xt β + εt как случайные переменные.

В течение многих времен t = 1..., T:

  • yt является наблюдаемым ответом.

  • xt является 1 на (p + 1) вектор - строка из наблюдаемых величин предикторов p. Размещать образцовое прерывание, x 1t = 1 для всего t.

  • β (p + 1)-by-1 вектор-столбец коэффициентов регрессии, соответствующих переменным, которые составляют столбцы xt.

  • εt является случайным воздействием со средним значением нуля и Cov (ε) = σ 2IT×T, в то время как ε является T-by-1 вектор, содержащий все воздействия. Эти предположения подразумевают, что вероятность данных

    (β,σ2|y,x)=t=1Tϕ(yt;xtβ,σ2).

    ϕ (yt; xtβ, σ 2) является Гауссовой плотностью вероятности со средним xtβ и отклонением σ 2 оцененных в yt;.

Прежде, чем рассмотреть данные, вы налагаете предположение joint prior distribution на (β, σ 2). В Байесовом анализе вы обновляете распределение параметров при помощи информации о параметрах, полученных из вероятности данных. Результатом является joint posterior distribution (β, σ 2) или conditional posterior distributions параметров.

Советы

  • Симуляция Монте-Карло подвергается изменению. Если estimate использует симуляцию Монте-Карло, то оценки и выводы могут отличаться, когда вы вызываете estimate многократно при на вид эквивалентных условиях. Чтобы воспроизвести результаты оценки, прежде, чем вызвать estimate, устанавливают seed случайных чисел при помощи rng.

  • Если estimate выдает ошибку при оценке, что апостериорное распределение с помощью пользовательской предшествующей модели, то пытается настроить начальные значения параметров при помощи BetaStart или Sigma2Start, или пытается настроить заявленный журнал предшествующая функция, и затем восстановить модель. Ошибка может указать, что журналом предшествующего распределения является –Inf в заданных начальных значениях.

Алгоритмы

  • Каждый раз, когда предшествующее распределение (PriorMdl) и вероятность данных приводит к аналитически послушному апостериорному распределению, estimate оценивает решения закрытой формы средств оценки Бейеса. В противном случае estimate обращается к симуляции Монте-Карло, чтобы оценить параметры и чертить выводы. Для получения дополнительной информации смотрите Следующую Оценку и Вывод.

  • Эта фигура иллюстрирует, как estimate уменьшает выборку Монте-Карло использование значений NumDraws, Thin и BurnIn.

    Прямоугольники представляют последовательные ничьи от распределения. estimate удаляет белые прямоугольники из выборки Монте-Карло. Остающийся NumDraws черные прямоугольники составляет выборку Монте-Карло.

Вопросы совместимости

развернуть все

Предупреждает запуск в R2018b

Введенный в R2017a

Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте