Чтение файла редукции данных Agilent Software
AGFEData
= agferead(File
)
File | Файл данных микромассивов, сгенерированный Agilent® Программное обеспечение редукции данных. |
считывает файлы, сгенерированные с помощью Редукции данных Software, из сканеров Agilent микромассива и создает структуру (AGFEData
= agferead(File
)AGFEData
) содержащие следующие поля:
Header
Stats
Columns
Rows
Names
IDs
Data
ColumnNames
TextData
TextColumnNames
Программное обеспечение редукции данных берёт изображение из сканера микромассивов Agilent и генерирует необработанные данные интенсивности для каждого пятна на диске.
Прочтите в выборке файла редукции данных Extraction Software. Обратите внимание, что файл fe_sample.txt
не обеспечивается программным обеспечением Bioinformatics Toolbox™.
agfeStruct = agferead('fe_sample.txt')
Постройте график медианного переднего плана.
maimage(agfeStruct,'gMedianSignal'); maboxplot(agfeStruct,'gMedianSignal');
affyread
| celintensityread
| galread
| geoseriesread
| geosoftread
| gprread
| ilmnbsread
| imageneread
| magetfield
| sptread