Чтение файла редукции данных Agilent Software
AGFEData = agferead(File)
File | Файл данных микромассивов, сгенерированный Agilent® Программное обеспечение редукции данных. |
считывает файлы, сгенерированные с помощью Редукции данных Software, из сканеров Agilent микромассива и создает структуру (AGFEData = agferead(File)AGFEData) содержащие следующие поля:
Header
Stats
Columns
Rows
Names
IDs
Data
ColumnNames
TextData
TextColumnNames
Программное обеспечение редукции данных берёт изображение из сканера микромассивов Agilent и генерирует необработанные данные интенсивности для каждого пятна на диске.
Прочтите в выборке файла редукции данных Extraction Software. Обратите внимание, что файл fe_sample.txt не обеспечивается программным обеспечением Bioinformatics Toolbox™.
agfeStruct = agferead('fe_sample.txt')Постройте график медианного переднего плана.
maimage(agfeStruct,'gMedianSignal'); maboxplot(agfeStruct,'gMedianSignal');
affyread | celintensityread | galread | geoseriesread | geosoftread | gprread | ilmnbsread | imageneread | magetfield | sptread