Exponenta Banner

getGeneNames

Класс: GTFAnotation

Извлечение уникальных имен генов из GTFAnnotation объект

Синтаксис

Genes = getGeneNames(AnnotObj)

Описание

Genes = getGeneNames(AnnotObj) возвращает Genes, массив ячеек из векторов символов, задающий уникальные имена генов, сопоставленные с аннотациями в AnnotObj.

Входные параметры

AnnotObj

Объект GTFAnnotation класс.

Выходные аргументы

Genes

Массив ячеек из символьных векторов, задающий уникальные имена генов, сопоставленные с аннотациями в AnnotObj.

Примеры

Создайте a GTFAnnotation объект из GTF-форматированного файла, который предоставляется с Bioinformatics Toolbox™, и затем извлекает список уникальных имен генов от объекта:

% Construct a GTFAnnotation object from a GTF file
GTFAnnotObj = GTFAnnotation('hum37_2_1M.gtf');
% Get gene names from object
geneNames = getGeneNames(GTFAnnotObj)
geneNames = 

    'uc002qvu.2'
    'uc002qvv.2'
    'uc002qvw.2'
    'uc002qvx.2'
    'uc002qvy.2'
    'uc002qvz.2'
    'uc002qwa.2'
    'uc002qwb.2'
    'uc002qwc.1'
    'uc002qwd.2'
    'uc002qwe.3'
    'uc002qwf.2'
    'uc002qwg.2'
    'uc002qwh.2'
    'uc002qwi.3'
    'uc002qwk.2'
    'uc002qwl.2'
    'uc002qwm.1'
    'uc002qwn.1'
    'uc002qwo.1'
    'uc002qwp.2'
    'uc002qwq.2'
    'uc010ewe.2'
    'uc010ewf.1'
    'uc010ewg.2'
    'uc010ewh.1'
    'uc010ewi.2'
    'uc010yim.1'

См. также

| | | | | | | | | | |

Темы

Внешние веб-сайты

Документация по Bioinformatics Toolbox

Поддержка