Класс: GTFAnnotation
Получите имена уникальной функции из GTFAnnotation объект
Features = getFeatureNames(AnnotObj)
Features = getFeatureNames(AnnotObj)Features, массив ячеек из символьных векторов, задающий имена уникальной функции, сопоставлен с аннотациями в AnnotObj.
|
Объект |
|
Массив ячеек из символьных векторов, задающий имена уникальной функции, сопоставлен с аннотациями в |
Создайте a GTFAnnotation объект из отформатированного GTF файла, которому предоставляют Bioinformatics Toolbox™, и затем получает имена функции из объекта аннотации:
% Construct a GTFAnnotation object from a GTF file
GTFAnnotObj = GTFAnnotation('hum37_2_1M.gtf');
% Retrieve feature names for the annotation object
featureNames = getFeatureNames(GTFAnnotObj)
featureNames =
'CDS'
'exon'
'start_codon'
'stop_codon'getData (GTFAnnotation) | getFeatureNames (GTFAnnotation) | getGeneNames (GTFAnnotation) | getGenes (GTFAnnotation) | getIndex (GTFAnnotation) | getRange (GTFAnnotation) | getReferenceNames (GTFAnnotation) | getSegments (GTFAnnotation) | getSubset (GTFAnnotation) | getTranscripts (GTFAnnotation) | GFFAnnotation | GTFAnnotation