Класс: GTFAnnotation
Получите ссылочные имена из GTFAnnotation
объект
References = getReferenceNames(AnnotObj)
возвращает References
= getReferenceNames(AnnotObj
)References
, массив ячеек из символьных векторов, задающий имена всех ссылочных последовательностей в AnnotObj
.
|
Объект |
|
Массив ячеек из символьных векторов, задающий имена всех ссылочных последовательностей в |
Создайте a GTFAnnotation
объект из отформатированного GTF файла, которому предоставляют Bioinformatics Toolbox™, и затем возвращает имена ссылочных последовательностей от объекта аннотации:
% Construct a GTFAnnotation object from a GTF file GTFAnnotObj = GTFAnnotation('hum37_2_1M.gtf'); % Return reference names for the annotation object refNames = getReferenceNames(GTFAnnotObj)
refNames = 'chr2'
getData (GTFAnnotation)
| getFeatureNames (GTFAnnotation)
| getGeneNames (GTFAnnotation)
| getGenes (GTFAnnotation)
| getIndex (GTFAnnotation)
| getRange (GTFAnnotation)
| getReferenceNames (GTFAnnotation)
| getSegments (GTFAnnotation)
| getSubset (GTFAnnotation)
| getTranscripts (GTFAnnotation)
| GFFAnnotation
| GTFAnnotation