Класс: GTFAnnotation
Получите уникальные названия генов из GTFAnnotation объект
Genes = getGeneNames(AnnotObj)
Genes = getGeneNames(AnnotObj)Genes, массив ячеек из символьных векторов, задающий уникальные названия генов, сопоставлен с аннотациями в AnnotObj.
|
Объект |
|
Массив ячеек из символьных векторов, задающий уникальные названия генов, сопоставлен с аннотациями в |
Создайте a GTFAnnotation объект из отформатированного GTF файла, которому предоставляют Bioinformatics Toolbox™, и затем получает список уникальных названий генов от объекта:
% Construct a GTFAnnotation object from a GTF file
GTFAnnotObj = GTFAnnotation('hum37_2_1M.gtf');
% Get gene names from object
geneNames = getGeneNames(GTFAnnotObj)geneNames =
'uc002qvu.2'
'uc002qvv.2'
'uc002qvw.2'
'uc002qvx.2'
'uc002qvy.2'
'uc002qvz.2'
'uc002qwa.2'
'uc002qwb.2'
'uc002qwc.1'
'uc002qwd.2'
'uc002qwe.3'
'uc002qwf.2'
'uc002qwg.2'
'uc002qwh.2'
'uc002qwi.3'
'uc002qwk.2'
'uc002qwl.2'
'uc002qwm.1'
'uc002qwn.1'
'uc002qwo.1'
'uc002qwp.2'
'uc002qwq.2'
'uc010ewe.2'
'uc010ewf.1'
'uc010ewg.2'
'uc010ewh.1'
'uc010ewi.2'
'uc010yim.1'
getData (GTFAnnotation) | getFeatureNames (GTFAnnotation) | getGeneNames (GTFAnnotation) | getGenes (GTFAnnotation) | getIndex (GTFAnnotation) | getRange (GTFAnnotation) | getReferenceNames (GTFAnnotation) | getSegments (GTFAnnotation) | getSubset (GTFAnnotation) | getTranscripts (GTFAnnotation) | GFFAnnotation | GTFAnnotation