Класс: GTFAnnotation
Возвратите таблицу неперекрывающихся сегментов от GTFAnnotation
объект
возвращает segments
= getSegments(AnnotObj
)segments
, таблица неперекрывающихся сегментов последовательностей нуклеотида, созданных путем выравнивания расшифровок стенограммы в AnnotObj
. Если контур экзона различный в двух или больше расшифровках стенограммы гена, то функция создает два или больше неперекрывающихся сегмента, которые покрывают все экзоны в расшифровке стенограммы.
[
возвращает segments
,transcriptIDs
]
= getSegments(AnnotObj
)transcriptIDs
, массив ячеек из символьных векторов, содержащий все уникальные идентификаторы расшифровки стенограммы в AnnotObj
.
getData (GTFAnnotation)
| getFeatureNames (GTFAnnotation)
| getGeneNames (GTFAnnotation)
| getGenes (GTFAnnotation)
| getIndex (GTFAnnotation)
| getRange (GTFAnnotation)
| getReferenceNames (GTFAnnotation)
| getSegments (GTFAnnotation)
| getSubset (GTFAnnotation)
| getTranscripts (GTFAnnotation)
| GFFAnnotation
| GTFAnnotation