Exponenta Banner
exponenta event banner

getFeatureNames

Класс: GFFAnnotation

Получение уникальных имен элементов из GFFAnnotation объект

Синтаксис

Features = getFeatureNames(AnnotObj)

Описание

Features = getFeatureNames(AnnotObj) прибыль Features, массив ячеек символьных векторов, задающих уникальные имена элементов, связанные с аннотациями в AnnotObj.

Входные аргументы

AnnotObj

Объект GFFAnnotation класс.

Выходные аргументы

Features

Массив ячеек векторов символов, задающих уникальные имена элементов, связанные с аннотациями в AnnotObj.

Примеры

Построить GFFAnnotation объект из файла в формате GFF, который поставляется с Toolbox™ биоинформатики, а затем извлекает имена элементов из объекта аннотации:

% Construct a GFFAnnotation object from a GFF file
GFFAnnotObj = GFFAnnotation('tair8_1.gff');
% Retrieve feature names for the annotation object
featureNames = getFeatureNames(GFFAnnotObj)

featureNames = 

    'CDS'
    'exon'
    'five_prime_UTR'
    'gene'
    'mRNA'
    'miRNA'
    'ncRNA'
    'protein'
    'pseudogene'
    'pseudogenic_exon'
    'pseudogenic_transcript'
    'tRNA'
    'three_prime_UTR'
    'transposable_element_gene'

См. также

| | | | | | |

Темы

Внешние веб-сайты

Документация по инструментарию биоинформатики

Поддержка