Класс: GFFAnnotation
Извлечение диапазона аннотаций из GFFAnnotation объект
Range = getRange(AnnotObj)
Range = getRange(AnnotObj)Range, числовой массив 1 на 2, задающий минимальное и максимальное положения в ссылочной последовательности, охватываемой аннотациями в AnnotObj.
|
Объект |
|
Числовой массив 1 на 2, определяющий минимальное и максимальное положения в ссылочной последовательности, охватываемой аннотациями в |
Построить GFFAnnotation объект из файла в формате GFF, который поставляется с Toolbox™ биоинформатики, а затем возвращает диапазон аннотаций элемента:
% Construct a GFFAnnotation object from a GFF file
GFFAnnotObj = GFFAnnotation('tair8_1.gff');
% Return first and last positions of reference associated with feature annotations
range = getRange(GFFAnnotObj)
range =
3631 498516
Используйте getSubset с помощью Reference пара имя-значение для возврата GFFAnnotation объект, содержащий только одну ссылочную последовательность. Затем используйте этот подзаданный объект в качестве входных данных для getRange способ.
getData (GFFAnnotation) | getFeatureNames (GFFAnnotation) | getIndex (GFFAnnotation) | getRange (GFFAnnotation) | getReferenceNames (GFFAnnotation) | getSubset (GFFAnnotation) | GFFAnnotation | GTFAnnotation