Sequence Viewer
Визуализация и интерактивное исследование биологических последовательностей
Описание
Приложение Sequence Viewer позволяет вам визуализировать и исследовать аминокислотные или нуклеотидные последовательности.
Вы можете:
Импортируйте последовательности из баз данных NCBI или EMBL непосредственно.
Просмотрите и исследуйте различные сведения о последовательности (такие как ORF и CDS) и основные статистические данные (такие как проценты количества оснований или количества аминокислот).
Просмотрите последовательности комплемента и противоположного комплемента и другие функции последовательности, такие как гены и экзоны.
Извлеките секции кодирования белка нуклеотидной последовательности и экспортируйте их в MATLAB® рабочей области.
Поиск характерных слов или шаблонов последовательности с помощью регулярных выражений.
Откройте приложение Sequence Viewer
MATLAB Toolstrip: На вкладке Apps, в разделе Computational Biology, щелкните значок приложения.
Командная строка MATLAB: Ввод
seqviewer.
Примеры
Откройте и просмотрите биологическую последовательность
Извлечение последовательности из GenBank® база данных.
S = getgenbank('M10051');Загрузите последовательность в приложение Sequence Viewer.
seqviewer(S)
Также можно нажать Sequence Viewer на вкладке Apps, чтобы открыть приложение и просмотреть биологическую последовательность S.
Закройте приложение.
seqviewer('close')