Анализ и визуализация сети
Примените основные алгоритмы теории графиков к взаимодействиям белок-белок (PPI) и другим генным сетям; просматривать сетевые отношения с помощью интерактивных карт, иерархических графиков и путей
Используйте различные графики для анализа генных сетей и взаимодействий белок-белок. Представление различных типов графиков с помощью разреженных матриц. Визуализируйте графики и сетевые отношения с помощью biograph объект, который позволяет вам вычислить положение узлов, нарисовать график и найти отношения между узлами.
Функции
graphallshortestpaths | Найти все кратчайшие пути в графике |
graphconncomp | Найдите сильно или слабо связанные компоненты в графике |
graphisdag | Тест на циклы в ориентированном графе |
graphisomorphism | Найдите изоморфизм между двумя графиками |
graphisspantree | Определите, является ли дерево покрывающим деревом |
graphmaxflow | Вычислите максимальное течение в ориентированном графе |
graphminspantree | Найдите минимальное покрывающее дерево в графике |
graphpred2path | Преобразуйте индексы предшественника в пути |
graphshortestpath | Решите задачу кратчайшего пути в графике |
graphtopoorder | Выполните топологический сортировку ориентированного ациклического графика |
graphtraverse | График Траверса путем следования за смежными узлами |
Классы
biograph | Создайте объект биографика |
biograph object | Структура данных, содержащая родовые взаимосвязанные данные, используемые для реализации ориентированного графа |
Темы
Функции теории графиков в Bioinformatics Toolbox™ применения основных алгоритмов теории графиков к разреженным матрицам.
Bioinformatics Toolbox включает функции, объекты и методы для создания, просмотра и манипулирования графиками, такими как интерактивные карты, иерархические графики и пути.
