geneticcode

Возврат нуклеотидного кодона к картированию аминокислот для генетического кода

Синтаксис

Map = geneticcode Map = geneticcode(GeneticCode)

Входные аргументы

GeneticCode

Целое число, символьный вектор или строка, указывающая номер генетического кода или имя кода из таблицы Генетический код. По умолчанию: 1 или 'Standard'.

Совет

При использовании кодового имени можно усечь имя до первых двух букв имени.

Выходные аргументы

Map Структура, содержащая отображение нуклеотидных кодонов на аминокислоты для стандартного генетического кода. Map структура содержит поле для каждого нуклеотидного кодона.

Описание

Map = geneticcode возвращает структуру, содержащую отображение нуклеотидных кодонов на аминокислоты для стандартного генетического кода. Map структура содержит поле для каждого нуклеотидного кодона.

Map = geneticcode(GeneticCode) возвращает структуру, содержащую отображение нуклеотидных кодонов на аминокислоты для указанного генетического кода. GeneticCode является либо:

Целое число, символьный вектор или строка, указывающая кодовый номер или кодовое имя из таблицы Генетический код
transl_table (код) номер с веб-страницы NCBI, описывающий генетические коды:
```
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Utils/wprintgc.cgi?mode=c
```

Совет

При использовании кодового имени можно усечь имя до первых двух букв имени.

Генетический код

Кодовый номер	Кодовое имя
`1`	`Standard`
`2`	`Vertebrate Mitochondrial`
`3`	`Yeast Mitochondrial`
`4`	`Mold`, `Protozoan`, `Coelenterate Mitochondrial`, и `Mycoplasma/Spiroplasma`
`5`	`Invertebrate Mitochondrial`
`6`	`Ciliate`, `Dasycladacean`, и `Hexamita Nuclear`
`9`	`Echinoderm Mitochondrial`
`10`	`Euplotid Nuclear`
`11`	`Bacterial` и `Plant Plastid`
`12`	`Alternative Yeast Nuclear`
`13`	`Ascidian Mitochondrial`
`14`	`Flatworm Mitochondrial`
`15`	`Blepharisma Nuclear`
`16`	`Chlorophycean Mitochondrial`
`21`	`Trematode Mitochondrial`
`22`	`Scenedesmus Obliquus Mitochondrial`
`23`	`Thraustochytrium Mitochondrial`

Примеры

Верните отображение нуклеотидных кодонов на аминокислоты для миохондриального генетического кода Flatworm.

wormmap = geneticcode('Flatworm Mitochondrial');

Ссылки

[1] Веб-страница NCBI, описывающая генетические коды:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Utils/wprintgc.cgi?mode=c

См. также

Представлен до R2006a

Документация