Класс: GTFAnnotation
Получение уникальных имен элементов из GTFAnnotation объект
Features = getFeatureNames(AnnotObj)
Features = getFeatureNames(AnnotObj)Features, массив ячеек символьных векторов, задающих уникальные имена элементов, связанные с аннотациями в AnnotObj.
|
Объект |
|
Массив ячеек векторов символов, задающих уникальные имена элементов, связанные с аннотациями в |
Построить GTFAnnotation объект из файла в формате GTF, который поставляется с Toolbox™ биоинформатики, а затем извлекает имена элементов из объекта аннотации:
% Construct a GTFAnnotation object from a GTF file
GTFAnnotObj = GTFAnnotation('hum37_2_1M.gtf');
% Retrieve feature names for the annotation object
featureNames = getFeatureNames(GTFAnnotObj)
featureNames =
'CDS'
'exon'
'start_codon'
'stop_codon'getData (GTFAnnotation) | getFeatureNames (GTFAnnotation) | getGeneNames (GTFAnnotation) | getGenes (GTFAnnotation) | getIndex (GTFAnnotation) | getRange (GTFAnnotation) | getReferenceNames (GTFAnnotation) | getSegments (GTFAnnotation) | getSubset (GTFAnnotation) | getTranscripts (GTFAnnotation) | GFFAnnotation | GTFAnnotation