Exponenta Banner
exponenta event banner

getGeneNames

Класс: GTFAnnotation

Получить уникальные имена генов из GTFAnnotation объект

Синтаксис

Genes = getGeneNames(AnnotObj)

Описание

Genes = getGeneNames(AnnotObj) прибыль Genes, клеточный массив символьных векторов, задающих уникальные имена генов, связанные с аннотациями в AnnotObj.

Входные аргументы

AnnotObj

Объект GTFAnnotation класс.

Выходные аргументы

Genes

Клеточный массив векторов символов, указывающий уникальные имена генов, связанные с аннотациями в AnnotObj.

Примеры

Построить GTFAnnotation объект из файла в формате GTF, который поставляется с Toolbox™ биоинформатики, а затем извлекает список уникальных имен генов из объекта:

% Construct a GTFAnnotation object from a GTF file
GTFAnnotObj = GTFAnnotation('hum37_2_1M.gtf');
% Get gene names from object
geneNames = getGeneNames(GTFAnnotObj)
geneNames = 

    'uc002qvu.2'
    'uc002qvv.2'
    'uc002qvw.2'
    'uc002qvx.2'
    'uc002qvy.2'
    'uc002qvz.2'
    'uc002qwa.2'
    'uc002qwb.2'
    'uc002qwc.1'
    'uc002qwd.2'
    'uc002qwe.3'
    'uc002qwf.2'
    'uc002qwg.2'
    'uc002qwh.2'
    'uc002qwi.3'
    'uc002qwk.2'
    'uc002qwl.2'
    'uc002qwm.1'
    'uc002qwn.1'
    'uc002qwo.1'
    'uc002qwp.2'
    'uc002qwq.2'
    'uc010ewe.2'
    'uc010ewf.1'
    'uc010ewg.2'
    'uc010ewh.1'
    'uc010ewi.2'
    'uc010yim.1'

См. также

| | | | | | | | | | |

Темы

Внешние веб-сайты

Документация по инструментарию биоинформатики

Поддержка