Класс: GTFAnnotation
Получение имен ссылок из GTFAnnotation объект
References = getReferenceNames(AnnotObj)
References = getReferenceNames(AnnotObj)References, массив ячеек символьных векторов, задающих имена всех опорных последовательностей в AnnotObj.
|
Объект |
|
Массив ячеек символьных векторов, задающих имена всех опорных последовательностей в |
Построить GTFAnnotation объект из файла в формате GTF, который поставляется с Toolbox™ биоинформатики, а затем возвращает имена ссылочных последовательностей из объекта аннотации:
% Construct a GTFAnnotation object from a GTF file
GTFAnnotObj = GTFAnnotation('hum37_2_1M.gtf');
% Return reference names for the annotation object
refNames = getReferenceNames(GTFAnnotObj)
refNames =
'chr2'
getData (GTFAnnotation) | getFeatureNames (GTFAnnotation) | getGeneNames (GTFAnnotation) | getGenes (GTFAnnotation) | getIndex (GTFAnnotation) | getRange (GTFAnnotation) | getReferenceNames (GTFAnnotation) | getSegments (GTFAnnotation) | getSubset (GTFAnnotation) | getTranscripts (GTFAnnotation) | GFFAnnotation | GTFAnnotation