fastqinfo

Возврат информации о файле FASTQ

Синтаксис

InfoStruct = fastqinfo(File)

Описание

InfoStruct = fastqinfo(File) возвращает MATLAB® структура, содержащая сводную информацию о FASTQ-форматированном файле.

Входные параметры

File

Вектор символов или строка, задающая имя файла или путь и имя файла FASTQ-форматированного файла. Если вы задаете только имя файла, этот файл должен быть в пути поиска файлов MATLAB или в текущей папке.

Выходные аргументы

InfoStruct

Структура MATLAB, содержащая сводную информацию о FASTQ-форматированном файле. Структура содержит следующие поля.

ОбластьОписание
FilenameИмя файла.
FilePathПуть к файлу
FileModDateДата изменения файла.
FileSizeРазмер файла в байтах.
NumberOfEntries Количество чтений последовательности в файле.

Примеры

Возвращает сводные данные содержимого файла FASTQ:

info = fastqinfo('SRR005164_1_50.fastq')

info = 

           Filename: 'SRR005164_1_50.fastq'
           FilePath: 'D:\2010_08_24_h11m43s32_job6027_pass\matlab\toolbox\bioinfo\biodemos'
        FileModDate: '03-Mar-2009 14:21:51'
           FileSize: 16702
    NumberOfEntries: 50

См. также

| | | | | | | | | | |

Темы

Внешние веб-сайты

Введенный в R2009b

Документация по Bioinformatics Toolbox

Поддержка

Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте