geneticcode

Возврат нуклеотидного кодона к аминокислотному отображению для генетического кода

Синтаксис

Map = geneticcode Map = geneticcode(GeneticCode)

Входные параметры

GeneticCode

Целое число, вектор символов или строка, задающая номер генетического кода или имя кода из таблицы Генетический код. По умолчанию это 1 или 'Standard'.

Совет

Если вы используете имя кода, можно обрезать имя до первых двух букв имени.

Выходные аргументы

Map Структура, содержащая отображение нуклеотидных кодонов с аминокислотами для стандартного генетического кода. The Map структура содержит поле для каждого нуклеотидного кодона.

Описание

Map = geneticcode возвращает структуру, содержащую отображение нуклеотидных кодонов с аминокислотами для стандартного генетического кода. The Map структура содержит поле для каждого нуклеотидного кодона.

Map = geneticcode(GeneticCode) возвращает структуру, содержащую отображение нуклеотидных кодонов с аминокислотами для заданного генетического кода. GeneticCode является либо:

Целое число, вектор символов или строка, указывающая номер кода или имя кода из таблицы Генетический код
The transl_table (код) номер с веб-страницы NCBI, описывающий генетические коды:
```
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Utils/wprintgc.cgi?mode=c
```

Совет

Если вы используете имя кода, можно обрезать имя до первых двух букв имени.

Генетический код

Кодовый номер	Кодовое имя
`1`	`Standard`
`2`	`Vertebrate Mitochondrial`
`3`	`Yeast Mitochondrial`
`4`	`Mold`, `Protozoan`, `Coelenterate Mitochondrial`, и `Mycoplasma/Spiroplasma`
`5`	`Invertebrate Mitochondrial`
`6`	`Ciliate`, `Dasycladacean`, и `Hexamita Nuclear`
`9`	`Echinoderm Mitochondrial`
`10`	`Euplotid Nuclear`
`11`	`Bacterial` и `Plant Plastid`
`12`	`Alternative Yeast Nuclear`
`13`	`Ascidian Mitochondrial`
`14`	`Flatworm Mitochondrial`
`15`	`Blepharisma Nuclear`
`16`	`Chlorophycean Mitochondrial`
`21`	`Trematode Mitochondrial`
`22`	`Scenedesmus Obliquus Mitochondrial`
`23`	`Thraustochytrium Mitochondrial`

Примеры

Верните отображение нуклеотидных кодонов к аминокислотам для митохондриального генетического кода Flatworm.

wormmap = geneticcode('Flatworm Mitochondrial');

Ссылки

[1] Веб-страница NCBI, описывающая генетические коды:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Utils/wprintgc.cgi?mode=c

См. также

Представлено до R2006a

Документация