Эксперименты по экспрессии генов микрочипов сложны, содержат данные и информацию из различных источников. Данные и информация такого эксперимента обычно подразделяются на четыре категории:
Значения данных измеренных выражений
Образец метаданных
Метаданные элементов микрочипов
Описание методов и условий эксперимента
В MATLAB ® можно представить все предыдущие данные и информацию в объекте ExpressionSet, который обычно содержит следующие объекты :
Один объект ExptData, содержащий значения выражений из эксперимента с микрочипами в одном или нескольких объектах DataMatrix
Один объект MetaData, содержащий образцы метаданных в двух массивах наборов данных
Один объект MetaData, содержащий метаданные элемента в двух массивах наборов данных
Один объект MIAME, содержащий описания экспериментов
На следующем рисунке показан типичный объект ExpressionSet и его объекты-компоненты.
Каждый элемент (объект DataMatrix) в объекте ExpressionSet имеет имя элемента. Кроме того, всегда существует один объект DataMatrix с именем элемента Expressions.
Объект ExpressionSet позволяет хранить, управлять и поднабор данных из эксперимента экспрессии генов микрочипов. Объект ExpressionSet включает свойства и методы, которые позволяют получать, извлекать и изменять данные, метаданные и другую информацию об эксперименте с микрочипами. Эти свойства и методы полезны для просмотра и анализа данных. Список свойств и методов см. в разделе Класс ExpressionSet.
Дополнительные сведения о построении и использовании объектов для данных и информации о экспрессии генов микрочипов см. в: