Эксперименты по экспрессии генов микромассивов являются комплексными, содержат данные и информацию из различных источников. Данные и информация такого эксперимента обычно подразделяются на четыре категории:
Значения измеренных экспрессионных данных
Образец метаданных
Метаданные функций микромассива
Описание методов и условий эксперимента
В MATLAB®можно представлять все предыдущие данные и информацию в объекте ExpressionSet, который обычно содержит следующие объекты:
Один объект ExptData, содержащий значения выражения из эксперимента с микромассивами в одном или нескольких объектах DataMatrix
Один объект MetaData, содержащий образец метаданных в двух массивах набора данных
Один объект MetaData, содержащий метаданные функций в двух массивах набора данных
Один объект MIAME, содержащий описания экспериментов
Следующий рисунок иллюстрирует типичный объект ExpressionSet и его объекты компонента.
Каждый элемент (объект DataMatrix) в объекте ExpressionSet имеет имя элемента. Кроме того, всегда существует один объект DataMatrix, имя элемента которого Expressions.
Объект ExpressionSet позволяет хранить, управлять и подставлять данные эксперимента по экспрессии генов микромассивов. Объект ExpressionSet включает свойства и методы, которые позволяют вам получать, извлекать и изменять данные, метаданные и другую информацию об эксперименте с микромассивами. Эти свойства и методы полезны для просмотра и анализа данных. Список свойств и методов см. в разделе Класс ExpressionSet.
Чтобы узнать больше о построении и использовании объектов для данных и информации о экспрессии генов микромассивов, смотрите:
