Анализ и визуализация сети

Примените основные алгоритмы теории графиков к взаимодействиям белок-белок (PPI) и другим генным сетям; просматривать сетевые отношения с помощью интерактивных карт, иерархических графиков и путей

Используйте различные графики для анализа генных сетей и взаимодействий белок-белок. Представление различных типов графиков с помощью разреженных матриц. Визуализируйте графики и сетевые отношения с помощью biograph объект, который позволяет вам вычислить положение узлов, нарисовать график и найти отношения между узлами.

Функции

graphallshortestpathsНайти все кратчайшие пути в графике
graphconncompНайдите сильно или слабо связанные компоненты в графике
graphisdagТест на циклы в ориентированном графе
graphisomorphismНайдите изоморфизм между двумя графиками
graphisspantreeОпределите, является ли дерево покрывающим деревом
graphmaxflowВычислите максимальное течение в ориентированном графе
graphminspantreeНайдите минимальное покрывающее дерево в графике
graphpred2pathПреобразуйте индексы предшественника в пути
graphshortestpathРешите задачу кратчайшего пути в графике
graphtopoorderВыполните топологический сортировку ориентированного ациклического графика
graphtraverseГрафик Траверса путем следования за смежными узлами

Классы

biographСоздайте объект биографика
biograph objectСтруктура данных, содержащая родовые взаимосвязанные данные, используемые для реализации ориентированного графа

Темы

Функции теории графиков

Функции теории графиков в Bioinformatics Toolbox™ применения основных алгоритмов теории графиков к разреженным матрицам.

Графическая визуализация

Bioinformatics Toolbox включает функции, объекты и методы для создания, просмотра и манипулирования графиками, такими как интерактивные карты, иерархические графики и пути.

Рекомендуемые примеры