affyread | Считывание данных микрочипов из файла Affymetrix GeneChip |
affysnpannotread | Чтение данных массива ДНК Affymetrix Mapping из файла аннотаций формата CSV |
affyprobeseqread | Считывание файла данных, содержащего информацию о последовательности зондов для массива Affymetrix GeneChip |
celintensityread | Считывание интенсивности зондов из файлов Affymetrix CEL |
getgeodata | Получение данных формата Omnibus (GEO) для экспрессии генов |
geoseriesread | Считывание данных формата серии GSE (Omnibus (GEO)) |
geosoftread | Данные формата Read Gene Expression Omnibus (GEO) SOFT |
galread | Считывание данных микрочипов из файла списка массивов GenePix |
gprread | Считывание данных микрочипов из файла результатов GenePix (GPR) |
agferead | Чтение файла программного обеспечения для извлечения элементов Agilent |
ilmnbsread | Считывание данных экспрессии генов, экспортированных из программного обеспечения Illumina BeadStudio |
imageneread | Считывание данных микрочипов из файла результатов ImaGene |
sptread | Считывание данных из файла SPOT |
goannotread | Чтение аннотаций из аннотированного файла Gene Ontology |
cytobandread | Чтение информации о цитогенетических связках |
bioma.ExpressionSet | Содержат данные эксперимента по экспрессии генов микрочипов |
bioma.data.ExptData | Содержат значения данных из эксперимента с микрочипами |
bioma.data.MetaData | Содержать метаданные из эксперимента с микрочипами |
bioma.data.MIAME | Содержат экспериментальную информацию из эксперимента по экспрессии генов микрочипов |
Управление данными экспрессии генов в объектах
Обзор объектов для данных экспрессии генов микрочипов
Представление значений данных выражения в объектах DataMatrix
Создание объектов DataMatrix, получение и установка свойств и доступ к данным.
Представление значений данных выражений в объектах ExptData
Создание объектов ExptData, использование свойств и методов, а также доступ к данным.
Представление метаданных образцов и элементов в объектах MetaData
Создание объектов MetaData, использование свойств и методов, а также доступ к данным.
Представление информации эксперимента в объекте MIAME
Создание объектов MIAME, использование свойств и методов, а также доступ к данным.
Представление всех данных в объекте ExpressionSet
Создание объектов ExpressionSet, использование свойств и методов, а также доступ к данным.
Обмен данными биоинформатики между Excel и MATLAB
Пример использования электронной таблицы Link™ с программным обеспечением для просмотра биоинформатических данных
Toolbox™ биоинформатики включает функции, объекты и методы создания, хранения и доступа к данным микрочипов.
Доступ к интерактивным базам данных и репозиториям с использованием различных функций MATLAB ® и импорт данных в рабочую область для дальнейшего анализа.
