| Просмотр последовательности | Визуализация и интерактивное исследование биологических последовательностей |
basecount | Подсчет нуклеотидов в последовательности |
codonbias | Вычислить частоту кодонов для каждой аминокислоты, кодированной в нуклеотидной последовательности |
codoncount | Подсчет кодонов в нуклеотидной последовательности |
dimercount | Подсчет димеров в нуклеотидной последовательности |
ntdensity | График плотности нуклеотидов по последовательности |
seqwordcount | Количество вхождений слова в последовательности |
nt2aa | Преобразование нуклеотидной последовательности в аминокислотную последовательность |
aa2nt | Преобразование аминокислотной последовательности в нуклеотидную последовательность |
nt2int | Преобразование нуклеотидной последовательности из буквенного в целочисленное представление |
int2nt | Преобразование нуклеотидной последовательности из целочисленного в буквенное представление |
dna2rna | Преобразование последовательности ДНК в последовательность РНК |
rna2dna | Преобразование последовательности РНК в последовательность ДНК |
revgeneticcode | Обратное отображение возврата (аминокислота к нуклеотидному кодону) для генетического кода |
seqcomplement | Вычислить комплементарную цепь нуклеотидной последовательности |
seqrcomplement | Рассчитать обратную комплементарную цепь нуклеотидной последовательности |
seqreverse | Рассчитать обратную цепь нуклеотидной последовательности |
baselookup | Поиск нуклеотидных кодов, целых чисел, имен и дополнений |
geneticcode | Возврат нуклеотидного кодона к картированию аминокислот для генетического кода |
oligoprop | Расчет свойств последовательности олигонуклеотида ДНК |
cpgisland | Найти острова CpG в последовательности ДНК |
joinseq | Объединение двух последовательностей для создания кратчайшей сверхчлени |
palindromes | Найти палиндромы в последовательности |
randseq | Генерировать случайную последовательность из конечного алфавита |
seqmatch | Поиск совпадений для каждого вектора символов в библиотеке |
seqviewer | Визуализация и интерактивное исследование биологических последовательностей |
seqdisp | Форматирование выходных данных длинной последовательности для удобства просмотра |
seqshoworfs | Последовательно отображать открытые рамки считывания |
featureparse | Анализ функций из данных GenBank, GenPept или EMBL |
featureview | Рисование линейной или круговой карты элементов из структуры GenBank |
seqconsensus | Расчет консенсусной последовательности |
seqdotplot | Создание точечного графика из двух последовательностей |
seqlogo | Логотип отображаемой последовательности для нуклеотидных или аминокислотных последовательностей |
seqprofile | Вычислить профиль последовательности из набора последовательностей с кратным выравниванием |
seqinsertgaps | Вставка зазоров в нуклеотидную или аминокислотную последовательность |
rebasecuts | Найти рестрикционные ферменты, которые разрезают нуклеотидную последовательность |
restrict | Расщепленная нуклеотидная последовательность в сайте рестрикции |
seq2regexp | Преобразование последовательности с неоднозначными символами в регулярное выражение |
Изучение нуклеотидной последовательности с помощью командной строки
Начиная с последовательности ДНК, вычислите статистику содержания нуклеотидов.
Изучение нуклеотидной последовательности с помощью приложения Sequence Viewer
Используйте графический интерфейс для функций последовательности.
Последовательность утилит и статистики
Вы можете манипулировать и анализировать ваши последовательности, чтобы получить более глубокое понимание физических, химических и биологических характеристик ваших данных.
