| Просмотр последовательности | Визуализация и интерактивное исследование биологических последовательностей |
aacount | Подсчет аминокислот в последовательности |
codonbias | Вычислить частоту кодонов для каждой аминокислоты, кодированной в нуклеотидной последовательности |
codoncount | Подсчет кодонов в нуклеотидной последовательности |
nmercount | Подсчет n-меров в нуклеотидной или аминокислотной последовательности |
seqwordcount | Количество вхождений слова в последовательности |
aa2nt | Преобразование аминокислотной последовательности в нуклеотидную последовательность |
nt2aa | Преобразование нуклеотидной последовательности в аминокислотную последовательность |
aa2int | Преобразование аминокислотной последовательности из буквенного в целочисленное представление |
int2aa | Преобразование аминокислотной последовательности из целочисленного в буквенное представление |
revgeneticcode | Обратное отображение возврата (аминокислота к нуклеотидному кодону) для генетического кода |
aminolookup | Найти аминокислотные коды, целые числа, сокращения, названия и кодоны |
geneticcode | Возврат нуклеотидного кодона к картированию аминокислот для генетического кода |
atomiccomp | Расчет атомного состава белка |
isoelectric | Оценка изоэлектрической точки для аминокислотной последовательности |
isotopicdist | Расчет массового распределения изотопов высокого разрешения и функции плотности |
molweight | Расчет молекулярной массы аминокислотной последовательности |
seqviewer | Визуализация и интерактивное исследование биологических последовательностей |
seqdisp | Форматирование выходных данных длинной последовательности для удобства просмотра |
seqshoworfs | Последовательно отображать открытые рамки считывания |
proteinplot | Открыть окно «График белка» для исследования свойств аминокислотной последовательности |
proteinpropplot | Свойства графика аминокислотной последовательности |
ramachandran | Рисование графика Рамачандрана для данных банка данных белка (PDB) |
seqconsensus | Расчет консенсусной последовательности |
seqdotplot | Создание точечного графика из двух последовательностей |
seqlogo | Логотип отображаемой последовательности для нуклеотидных или аминокислотных последовательностей |
seqprofile | Вычислить профиль последовательности из набора последовательностей с кратным выравниванием |
seqinsertgaps | Вставка зазоров в нуклеотидную или аминокислотную последовательность |
cleave | Расщепление аминокислотной последовательности ферментом |
cleavelookup | Найти правило расщепления для фермента или соединения |
seq2regexp | Преобразование последовательности с неоднозначными символами в регулярное выражение |
featureparse | Анализ функций из данных GenBank, GenPept или EMBL |
randseq | Генерировать случайную последовательность из конечного алфавита |
seqmatch | Поиск совпадений для каждого вектора символов в библиотеке |
Изучение последовательности белков с помощью приложения Sequence Viewer
Используйте средство просмотра биологических последовательностей для исследования последовательностей белков
Сравнение последовательностей с использованием алгоритмов выравнивания последовательностей
Определение сходства между двумя последовательностями является общей задачей в вычислительной биологии.
Для извлечения информации из данных можно использовать набор методов анализа белка.
Последовательность утилит и статистики
Вы можете манипулировать и анализировать ваши последовательности, чтобы получить более глубокое понимание физических, химических и биологических характеристик ваших данных.
